19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3019 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3019  hypothetical protein  100 
 
 
525 aa  1083    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1309  hypothetical protein  35.81 
 
 
614 aa  350  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0453765  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5216  hypothetical protein  34.56 
 
 
553 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1197  hypothetical protein  32.4 
 
 
545 aa  257  4e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397555 
 
 
-
 
NC_002950  PG0414  hypothetical protein  31.21 
 
 
626 aa  233  6e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.867976 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06755  hypothetical protein  28.36 
 
 
582 aa  209  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2592  OstA family protein  28.4 
 
 
549 aa  206  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1594  OstA family protein  27.97 
 
 
560 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0594  OstA family protein  26.25 
 
 
496 aa  153  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6193  OstA family protein  35.78 
 
 
709 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0493  hypothetical protein  36.63 
 
 
767 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0205  hypothetical protein  24.6 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.676053  normal  0.0127531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2554  hypothetical protein  24.86 
 
 
313 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0429099  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2797  hypothetical protein  24.73 
 
 
316 aa  63.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2035  hypothetical protein  24.31 
 
 
396 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000607972  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2391  OstA family protein  23.33 
 
 
307 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0196  hypothetical protein  28.85 
 
 
305 aa  62  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0743  OstA family protein  25.43 
 
 
435 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.8238399999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2095  OstA family protein  29.13 
 
 
296 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>