101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0110 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0110  putative periplasmic protein  100 
 
 
275 aa  553  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1563  putative periplasmic protein  36 
 
 
275 aa  186  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0019619  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1306  hypothetical protein  31.39 
 
 
271 aa  152  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1481  hypothetical protein  31.02 
 
 
271 aa  152  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0549  ferric receptor CfrA  32 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.234857  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0433  hypothetical protein  30.29 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0243  putative periplasmic protein  30.55 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1294  hypothetical protein  30.58 
 
 
275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2197  hypothetical protein  28.31 
 
 
283 aa  127  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000001715  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0146  hypothetical protein  29.23 
 
 
278 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0022721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.86 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0670  SurA domain  26.37 
 
 
447 aa  60.1  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  28.72 
 
 
429 aa  59.3  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  30.41 
 
 
438 aa  58.9  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.78 
 
 
471 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0142  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.51 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  28.72 
 
 
429 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2037  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  26.58 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147855  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0200  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.24 
 
 
433 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  22.22 
 
 
465 aa  57  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3469  SurA domain protein  34.86 
 
 
471 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.955997  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  27.07 
 
 
311 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04643  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.58 
 
 
463 aa  55.8  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4862  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.78 
 
 
473 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042366 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  20 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.94 
 
 
437 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4225  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.17 
 
 
369 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350746  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.34 
 
 
427 aa  53.9  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0966  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.15 
 
 
434 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000138448  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2011  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.93 
 
 
468 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1935  SurA domain-containing protein  33.93 
 
 
463 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0015  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  22.77 
 
 
321 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.33 
 
 
432 aa  52.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.73 
 
 
430 aa  52.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1153  hypothetical protein  39.22 
 
 
58 aa  52  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  25.19 
 
 
439 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.23 
 
 
442 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0498  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.5 
 
 
499 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.307717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.22 
 
 
326 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  25.19 
 
 
439 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2817  survival protein surA  26.87 
 
 
434 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.705055  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3442  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.22 
 
 
434 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000041378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0770  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.22 
 
 
434 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524485  normal  0.0902851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3571  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24.22 
 
 
434 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  24.74 
 
 
441 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1016  SurA domain-containing protein  28.46 
 
 
434 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000539949  hitchhiker  0.00270369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.06 
 
 
438 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  23.65 
 
 
441 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.79 
 
 
493 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.8 
 
 
428 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.8 
 
 
430 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3589  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.08 
 
 
321 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000412854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3549  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.59 
 
 
333 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000983589  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1262  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.68 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28 
 
 
430 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2715  SurA domain protein  29.46 
 
 
443 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109912  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0203  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.68 
 
 
437 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.701939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2863  survival protein SurA  28.36 
 
 
431 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00164728  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00810  hypothetical protein  25.95 
 
 
427 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0568  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.57 
 
 
353 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000504659  normal  0.286887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0864  SurA domain-containing protein  26.15 
 
 
434 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0979  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.89 
 
 
434 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6034  SurA domain-containing protein  28.07 
 
 
475 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001663  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.95 
 
 
427 aa  46.6  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4763  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.95 
 
 
476 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.68 
 
 
426 aa  45.8  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0676  SurA domain  27.14 
 
 
453 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03412  survival protein surA  23.7 
 
 
427 aa  45.8  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  25.19 
 
 
454 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218368  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4075  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.52 
 
 
469 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0881  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.15 
 
 
434 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000301767  normal  0.688163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1048  SurA domain-containing protein  26.05 
 
 
434 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000188646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1081  SurA domain-containing protein  26.05 
 
 
434 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00545123  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3311  SurA domain protein  26.05 
 
 
434 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000542375  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  24.6 
 
 
320 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1716  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.64 
 
 
380 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  25.69 
 
 
475 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0955  SurA domain protein  22.06 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0209  survival protein SurA, putative  28.78 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0872  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.78 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0576  survival protein SurA, putative  26.16 
 
 
448 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566553  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3207  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.05 
 
 
434 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00341514  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2736  putative survival protein SurA  28.78 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2342  putative survival protein SurA  28.78 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0693  putative survival protein SurA  28.78 
 
 
450 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0707  putative survival protein SurA  28.78 
 
 
450 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2422  putative survival protein SurA  28.78 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.30012  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0991  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.82 
 
 
434 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000134867  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3912  SurA domain-containing protein  23.81 
 
 
464 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.99 
 
 
482 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1573  SurA domain  29.63 
 
 
482 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0907  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.21 
 
 
434 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00235031  normal  0.382454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3113  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.21 
 
 
434 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.980889  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0108  basic membrane protein  26.47 
 
 
336 aa  43.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  24.37 
 
 
434 aa  42.7  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3341  SurA domain-containing protein  21.88 
 
 
443 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.814478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0698  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.27 
 
 
355 aa  42.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000883424  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0418  SurA domain  30.16 
 
 
316 aa  42.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.027362  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0097  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.38 
 
 
459 aa  42.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1049  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.03 
 
 
439 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352808  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>