55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1563 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1563  putative periplasmic protein  100 
 
 		 275 aa  554  1e-157  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0019619  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0549  ferric receptor CfrA  41.83 
 
 		 291 aa  215  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.234857  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0243  putative periplasmic protein  37.18 
 
 		 276 aa  188  7e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0110  putative periplasmic protein  36 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1306  hypothetical protein  31.75 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0433  hypothetical protein  32.61 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1481  hypothetical protein  31.39 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1294  hypothetical protein  29.78 
 
 		 275 aa  155  9e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2197  hypothetical protein  30.32 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000001715  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0146  hypothetical protein  28.62 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0022721  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6034  SurA domain-containing protein  24.43 
 
 		 475 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1716  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.09 
 
 		 380 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.62 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  20.48 
 
 		 311 aa  49.3  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5274  SurA domain protein  32.73 
 
 		 469 aa  49.3  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4225  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.75 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350746  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0568  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.22 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000504659  normal  0.286887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3549  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.56 
 
 		 333 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000983589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  23.31 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0693  putative survival protein SurA  28.33 
 
 		 450 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  28.78 
 
 		 439 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0707  putative survival protein SurA  28.33 
 
 		 450 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2422  putative survival protein SurA  28.33 
 
 		 448 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.30012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  28.78 
 
 		 439 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  25.35 
 
 		 441 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  26.06 
 
 		 441 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0872  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.33 
 
 		 448 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2736  putative survival protein SurA  28.33 
 
 		 448 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2342  putative survival protein SurA  28.33 
 
 		 448 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0209  survival protein SurA, putative  28.33 
 
 		 448 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.78 
 
 		 482 aa  46.2  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0576  survival protein SurA, putative  28.33 
 
 		 448 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0397  SurA domain-containing protein  26.72 
 
 		 463 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3589  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  18.86 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000412854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1053  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.16 
 
 		 416 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0556078  normal  0.850667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2327  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.55 
 
 		 442 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110216  normal  0.9972 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2710  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.77 
 
 		 452 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  26.76 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2098  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.77 
 
 		 452 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941822  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  26.06 
 
 		 429 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0090  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  19.69 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2737  SurA domain-containing protein  26.77 
 
 		 452 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0142  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  19.87 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.75 
 
 		 471 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.76 
 
 		 442 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6037  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.98 
 
 		 452 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643718  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3469  SurA domain protein  25.75 
 
 		 471 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.955997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12160  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.57 
 
 		 495 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000838067  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2628  SurA domain-containing protein  25.98 
 
 		 452 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2762  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.19 
 
 		 452 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1560  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, PPIC-type  23.1 
 
 		 314 aa  42.4  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000278048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0806  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.32 
 
 		 458 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.646398 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.48 
 
 		 426 aa  42  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0589  SurA domain-containing protein  24.43 
 
 		 451 aa  42  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  26.02 
 
 		 465 aa  42  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>