57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0243 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0243  putative periplasmic protein  100 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0549  ferric receptor CfrA  64.13 
 
 		 291 aa  371  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.234857  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1563  putative periplasmic protein  37.18 
 
 		 275 aa  188  7e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0019619  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1294  hypothetical protein  34.8 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0433  hypothetical protein  32.61 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1306  hypothetical protein  32.61 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1481  hypothetical protein  32.25 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2197  hypothetical protein  29.96 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000001715  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0110  putative periplasmic protein  30.55 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0146  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0022721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0199  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.97 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000517343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0142  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.15 
 
 		 345 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  22.51 
 
 		 441 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0595  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.13 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.880292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0216  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.74 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000196807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  21.77 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3589  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000412854  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  22.67 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  21.4 
 
 		 439 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  21.4 
 
 		 439 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  20.82 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3549  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.32 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000983589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0015  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  27.06 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1560  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, PPIC-type  29.84 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000278048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.35 
 
 		 426 aa  52  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0912  SurA domain protein  20.2 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.557148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0698  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.86 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000883424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.18 
 
 		 482 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  19.68 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0729  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.6 
 
 		 314 aa  49.7  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0498  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.22 
 
 		 499 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.307717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1716  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.09 
 
 		 380 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4225  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.77 
 
 		 369 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350746  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0670  SurA domain  23.67 
 
 		 447 aa  49.3  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4874  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.31 
 
 		 349 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.165645  normal  0.245962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.26 
 
 		 430 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.14 
 
 		 427 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.26 
 
 		 430 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4335  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.36 
 
 		 338 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04643  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.72 
 
 		 463 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4471  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.32 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.4 
 
 		 493 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4490  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.32 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.32 
 
 		 442 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.78 
 
 		 430 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0955  SurA domain protein  23.81 
 
 		 317 aa  45.8  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  18.75 
 
 		 435 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0864  SurA domain-containing protein  24.48 
 
 		 434 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.63 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.63 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.01 
 
 		 430 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.22 
 
 		 426 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3022  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.31 
 
 		 630 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  22.78 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.87 
 
 		 428 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.74 
 
 		 447 aa  42  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.58 
 
 		 437 aa  42  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>