43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2197 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2197  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  569  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000001715  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0549  ferric receptor CfrA  32.95 
 
 		 291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.234857  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1563  putative periplasmic protein  30.32 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0019619  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0243  putative periplasmic protein  29.96 
 
 		 276 aa  153  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1294  hypothetical protein  29.6 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0110  putative periplasmic protein  28.31 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0146  hypothetical protein  28.42 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0022721  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1481  hypothetical protein  29.04 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0433  hypothetical protein  29.78 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1306  hypothetical protein  29.04 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3589  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.32 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000412854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0142  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.34 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0698  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.12 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000883424  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.27 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.284455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0199  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.74 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000517343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  20.99 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3549  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.55 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000983589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0659  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.64 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0216  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.4 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000196807  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.6 
 
 		 471 aa  52.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2037  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  22.95 
 
 		 329 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147855  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3469  SurA domain protein  25.6 
 
 		 471 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.955997  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4489  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.49 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4470  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.49 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0015  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4334  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.61 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0090  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  20.09 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6034  SurA domain-containing protein  22.97 
 
 		 475 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2327  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.91 
 
 		 442 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110216  normal  0.9972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.88 
 
 		 493 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2969  hypothetical protein  21.13 
 
 		 309 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3588  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.74 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000961276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0568  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.9 
 
 		 353 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000504659  normal  0.286887 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0912  SurA domain protein  19.31 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.557148  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.81 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.36 
 
 		 440 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.03 
 
 		 438 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0498  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.66 
 
 		 499 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.307717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2432  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.23 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1262  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.03 
 
 		 343 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  24.35 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0699  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.12 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000032571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  18.18 
 
 		 316 aa  42.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>