40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1469 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1469  transformation system protein  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1458  transformation system protein  52.66 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.476694  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1172  transformation system protein  52.11 
 
 		 191 aa  201  6e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1047  transformation system protein  52.11 
 
 		 191 aa  201  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.733048  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0760  transformation system protein  52.63 
 
 		 191 aa  201  7e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00157325  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0860  hypothetical protein  54.79 
 
 		 189 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1143  conserved hypothetical protein, possible purine/pyrimidine phosphoribosyltransferase  49.47 
 
 		 190 aa  193  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1215  transformation system protein  42.24 
 
 		 233 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1638  transformation system protein  48.4 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0309  hypothetical protein  44.21 
 
 		 190 aa  160  7e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  27.64 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  28.35 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  24.74 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  25.82 
 
 		 227 aa  48.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  27.27 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  26 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  24.15 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  23.6 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  26.21 
 
 		 230 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  21.89 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  25.56 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  24.64 
 
 		 234 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  25.56 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  27.17 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  24.5 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  24.59 
 
 		 233 aa  45.1  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.43 
 
 		 226 aa  44.7  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  25 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  24.86 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1648  phosphoribosyltransferase  21.65 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  25.13 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  24.26 
 
 		 234 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  24.26 
 
 		 234 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2548  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.81 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  23.74 
 
 		 204 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  25.46 
 
 		 245 aa  41.2  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  23.86 
 
 		 230 aa  41.2  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.95 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>