23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1220 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1220  acetyltransferase  100 
 
 		 713 aa  1444    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.60212  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0460  hydroxylamine reductase (hybrid-cluster protein; HCP)  46.71 
 
 		 709 aa  621  1e-176  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00649347  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1213  general glycosylation pathway protein  41.86 
 
 		 708 aa  587  1e-166  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1383  general glycosylation pathway protein  40.29 
 
 		 758 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0452  iron chelatin ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 		 699 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.210774  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1253  oligosaccharide transferase to N-glycosylate proteins  41.44 
 
 		 712 aa  509  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1268  general glycosylation pathway protein  40.56 
 
 		 713 aa  501  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.696771  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1143  general glycosylation pathway protein  40.28 
 
 		 713 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0954  general glycosylation pathway protein  40.74 
 
 		 729 aa  500  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.16886  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0595  general glycosylation pathway protein  40.31 
 
 		 713 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1474  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  38.36 
 
 		 699 aa  481  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1767  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  36.77 
 
 		 715 aa  462  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3265  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.7 
 
 		 704 aa  95.9  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0285  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.12 
 
 		 736 aa  76.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.272509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3699  hypothetical protein  21.23 
 
 		 722 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0746  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  19.16 
 
 		 816 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0846  hypothetical protein  18.56 
 
 		 782 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110581 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0669  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  19.52 
 
 		 851 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0627584  normal  0.110022 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1810  hypothetical protein  26.2 
 
 		 758 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.601276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0735  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.5 
 
 		 853 aa  55.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0154  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  21.94 
 
 		 853 aa  53.9  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1249  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.99 
 
 		 851 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.209771  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01850  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 		 815 aa  47.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>