21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1213 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1268  general glycosylation pathway protein  48.06 
 
 		 713 aa  646    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.696771  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1383  general glycosylation pathway protein  50.2 
 
 		 758 aa  751    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1253  oligosaccharide transferase to N-glycosylate proteins  49.36 
 
 		 712 aa  674    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1143  general glycosylation pathway protein  48.06 
 
 		 713 aa  648    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0452  iron chelatin ABC transporter, permease protein  68.67 
 
 		 699 aa  980    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0595  general glycosylation pathway protein  47.92 
 
 		 713 aa  640    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0954  general glycosylation pathway protein  49.72 
 
 		 729 aa  697    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.16886  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1213  general glycosylation pathway protein  100 
 
 		 708 aa  1429    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1220  acetyltransferase  41.86 
 
 		 713 aa  594  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.60212  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1474  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  42.86 
 
 		 699 aa  541  9.999999999999999e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1767  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  41.47 
 
 		 715 aa  526  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0460  hydroxylamine reductase (hybrid-cluster protein; HCP)  38.23 
 
 		 709 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00649347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3265  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.71 
 
 		 704 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1810  hypothetical protein  22.4 
 
 		 758 aa  100  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.601276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0285  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.35 
 
 		 736 aa  95.9  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.272509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3699  hypothetical protein  23.37 
 
 		 722 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0846  hypothetical protein  23.44 
 
 		 782 aa  72  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110581 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0746  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  20.55 
 
 		 816 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0669  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.32 
 
 		 851 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0627584  normal  0.110022 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0154  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  23.53 
 
 		 853 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1249  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.58 
 
 		 851 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.209771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>