More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1548 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1548  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
431 aa  882    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0633962  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0438  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  89.77 
 
 
431 aa  801    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000382192  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1380  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  71 
 
 
433 aa  623  1e-177  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0105  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  66.98 
 
 
429 aa  592  1e-168  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347504  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0717  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  64.65 
 
 
431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.213331  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0932  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0861  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.10335  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0994  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  65.97 
 
 
431 aa  571  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0283797  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1059  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 
432 aa  491  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0217946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
488 aa  277  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
464 aa  273  4.0000000000000004e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
482 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
486 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
491 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
488 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
485 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
477 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 
485 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
479 aa  260  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 
466 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
469 aa  259  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
464 aa  258  2e-67  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
465 aa  255  9e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
467 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
467 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
482 aa  251  2e-65  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
469 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
469 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
469 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
469 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
504 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
466 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
504 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
504 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
512 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
469 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
467 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
469 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
469 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
494 aa  247  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
494 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
465 aa  246  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
463 aa  246  4e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
490 aa  247  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
478 aa  246  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
469 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
484 aa  244  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
469 aa  243  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
469 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
493 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
490 aa  242  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
472 aa  242  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
500 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
469 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1642  glutamyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
469 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000802053  normal  0.126608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
491 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 
483 aa  240  5e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 
469 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
490 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
501 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
490 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
491 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
485 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1114  glutamyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 
465 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00321012  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0680  Glutamyl/glutaminyl-tRNA synthetase, class Ic, catalytic domain protein  35.73 
 
 
380 aa  237  4e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.273133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
485 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
469 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
485 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
485 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
485 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
485 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
485 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
489 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 
463 aa  236  6e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 
463 aa  236  6e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1022  glutamyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 
465 aa  236  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000173341  normal  0.120232 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 
492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 
474 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
499 aa  234  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
484 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
484 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
481 aa  233  6e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
480 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  31.03 
 
 
546 aa  233  7.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 
474 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 
474 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 
495 aa  232  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
463 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
469 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
471 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
491 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
473 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 
498 aa  230  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
468 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>