26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0491 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  100 
 
 
149 aa  306  6.999999999999999e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  53.38 
 
 
150 aa  183  7e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  50.66 
 
 
151 aa  158  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  48.63 
 
 
151 aa  143  9e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  40.69 
 
 
152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  37.16 
 
 
150 aa  121  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  37.16 
 
 
150 aa  120  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  36.49 
 
 
150 aa  120  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  42.14 
 
 
141 aa  120  8e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  37.16 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  32.26 
 
 
216 aa  53.1  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  29.66 
 
 
166 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  24.44 
 
 
198 aa  50.4  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  28.97 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  25.52 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  25.19 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  35.29 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  30.38 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  35.29 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  25 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1103  hypothetical protein  28.92 
 
 
284 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200341  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1594  hypothetical protein  30.38 
 
 
180 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00724024  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  23.27 
 
 
158 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  30.12 
 
 
406 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  26.71 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>