More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00030 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00030  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 124 aa  229  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  78.23 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  69.35 
 
 		 124 aa  155  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3450  50S ribosomal protein L7/L12  74.22 
 
 		 128 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0256667  normal  0.0368357 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1397  50S ribosomal protein L7/L12  76.38 
 
 		 127 aa  151  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0425  50S ribosomal protein L7/L12  76.38 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1942  50S ribosomal protein L7/L12  77.42 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.542016  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4478  ribosomal protein L7/L12  75 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0848  50S ribosomal protein L7/L12  75.81 
 
 		 124 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  70.63 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0393  50S ribosomal protein L7/L12  72.8 
 
 		 125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  55.46 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0567  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 125 aa  105  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  51.75 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 		 123 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0746  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00478946 
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2543  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0352  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1700  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  53.78 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0338  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0233  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  52.89 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  45.97 
 
 		 125 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  47.2 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  52 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 123 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  58.93 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  47.2 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  52 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  47.93 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  47.9 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  45.6 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  49.21 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  46.92 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  48.39 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  46.83 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  54.92 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 126 aa  95.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  51.28 
 
 		 126 aa  95.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  47.93 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  47.58 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  52.68 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  66.2 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  53.1 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  48.03 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  47.9 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 123 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  46.67 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  56.14 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  51.2 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  56.14 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  53.57 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  53.78 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>