50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2344 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2344  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  214  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  83.67 
 
 		 101 aa  165  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  76.04 
 
 		 105 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  50.52 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  49.47 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  43.48 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  34.38 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  34.38 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  35.29 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  31.96 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2131  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75658  normal  0.434651 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1038  regulatory proteins, MerR family protein  44.44 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2315  chaperone-modulator protein CbpM  40.66 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1235  chaperone-modulator protein CbpM  40.66 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2125  chaperone-modulator protein CbpM  40.66 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2596  chaperone-modulator protein CbpM  40.66 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  37.04 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01002  modulator of CbpA co-chaperone  40.66 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01009  hypothetical protein  40.66 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1111  chaperone-modulator protein CbpM  40.66 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1117  chaperone-modulator protein CbpM  40.66 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2643  chaperone-modulator protein CbpM  40.66 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.813926  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  30.93 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  36.36 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2221  MerR family regulatory protein  35.9 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215829  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  39.24 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  39.24 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  39.24 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  39.24 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  39.24 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  37.36 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3861  chaperone-modulator protein CbpM  34.57 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.346166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2064  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  41.38 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  39.66 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  39.66 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  39.66 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0050  hypothetical protein  33.75 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0491  hypothetical protein  39.02 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0186  hypothetical protein  36.59 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2701  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0565675  hitchhiker  0.00000000716419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0553  hypothetical protein  44 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.944061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0048  hypothetical protein  44 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3237  hypothetical protein  36.71 
 
 		 104 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3755  hypothetical protein  37.31 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0821267  normal  0.731479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0568  hypothetical protein  29.49 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0186842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0617  MerR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0638  MerR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>