34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0980 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0980  putative gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615831 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5801  carboxymuconolactone decarboxylase  82.57 
 
 		 261 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.558099  normal  0.179453 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3411  carboxymuconolactone decarboxylase  62.5 
 
 		 250 aa  309  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3248  carboxymuconolactone decarboxylase  57.37 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0991  putative gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  47.44 
 
 		 274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7140  carboxymuconolactone decarboxylase  42.15 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0317  hypothetical protein  32.38 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.388122 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4714  carboxymuconolactone decarboxylase  48.48 
 
 		 135 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0927344  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3953  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.28 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3840  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.28 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7418  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  27.88 
 
 		 221 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.0051102  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1467  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  29.58 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  43.48 
 
 		 115 aa  52.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  30.17 
 
 		 116 aa  48.9  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  36.84 
 
 		 117 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.19 
 
 		 113 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.98 
 
 		 114 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  36.84 
 
 		 114 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  36.84 
 
 		 114 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.14 
 
 		 114 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  34.74 
 
 		 115 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.74 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  26.94 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.07 
 
 		 127 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  30.53 
 
 		 120 aa  42.7  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  32.89 
 
 		 119 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.93 
 
 		 109 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  34.21 
 
 		 108 aa  42  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  32.93 
 
 		 109 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  32.93 
 
 		 109 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  32.93 
 
 		 109 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  32.93 
 
 		 109 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.93 
 
 		 109 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>