More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3659 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3659  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
251 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0975  uroporphyrin-III C-methyltransferase  91.24 
 
 
251 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2230  uroporphyrin-III C-methyltransferase  86.67 
 
 
255 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572034  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5801  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.05 
 
 
249 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0785741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0819  uroporphyrin-III C-methyltransferase  85.59 
 
 
257 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1859  uroporphyrin-III C-methyltransferase  82.63 
 
 
249 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2470  uroporphyrin-III C-methyltransferase  82.63 
 
 
249 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2387  uroporphyrin-III C-methyltransferase  82.2 
 
 
249 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2475  uroporphyrin-III C-methyltransferase  82.2 
 
 
249 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.9 
 
 
278 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.9 
 
 
257 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219078  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1657  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.9 
 
 
257 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1171  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.9 
 
 
257 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1018  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.9 
 
 
257 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2942  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.9 
 
 
259 aa  360  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1011  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.47 
 
 
259 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  81.78 
 
 
249 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0824  uroporphyrin-III C-methyltransferase  81.56 
 
 
252 aa  357  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350857  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2811  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.64 
 
 
254 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.481066  normal  0.964939 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.18 
 
 
273 aa  286  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2691  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.52 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2684  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.08 
 
 
269 aa  261  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2420  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.92 
 
 
269 aa  260  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2224  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.66 
 
 
269 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0998  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
267 aa  221  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0051  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.59 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0142442  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.64 
 
 
478 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.22 
 
 
478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.34 
 
 
271 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.64 
 
 
484 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  43.75 
 
 
464 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
276 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.35 
 
 
273 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.49 
 
 
272 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  44.12 
 
 
477 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.61 
 
 
276 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.61 
 
 
276 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  44.12 
 
 
478 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.51 
 
 
462 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.33 
 
 
464 aa  168  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.75 
 
 
277 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  43.33 
 
 
464 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.6 
 
 
464 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.91 
 
 
259 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.7 
 
 
475 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.26 
 
 
273 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  42.86 
 
 
465 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.26 
 
 
273 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  43.22 
 
 
485 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.08 
 
 
503 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.64 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1710  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.56 
 
 
298 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.92 
 
 
276 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.26 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  42.44 
 
 
465 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.98 
 
 
506 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.76 
 
 
480 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.86 
 
 
463 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.22 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.6 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.08 
 
 
464 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.92 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.86 
 
 
463 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.67 
 
 
463 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
281 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
281 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.04 
 
 
269 aa  162  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.31 
 
 
528 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.67 
 
 
258 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.08 
 
 
258 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.84 
 
 
258 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.49 
 
 
481 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.26 
 
 
258 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0206  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  40.91 
 
 
474 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
503 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.58 
 
 
258 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.34 
 
 
479 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1899  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.02 
 
 
247 aa  159  4e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.106927 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.26 
 
 
248 aa  159  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.06 
 
 
277 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.06 
 
 
482 aa  158  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3269  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
317 aa  158  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.848441  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1988  uroporphyrinogen-III methylase SirB, putative  42.44 
 
 
311 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.17 
 
 
487 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0115  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.19 
 
 
244 aa  157  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.13 
 
 
508 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  41.88 
 
 
554 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  41.32 
 
 
520 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.43 
 
 
258 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.02 
 
 
258 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.91 
 
 
510 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2282  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  41.08 
 
 
264 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.17 
 
 
473 aa  156  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.06 
 
 
277 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.55 
 
 
258 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3452  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.57 
 
 
525 aa  155  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  41.28 
 
 
462 aa  155  4e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3164  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  35.98 
 
 
474 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.530795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>