46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4243 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  59.66 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  54.46 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  52.81 
 
 		 245 aa  214  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  38.59 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  39 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  38.59 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  40.27 
 
 		 206 aa  122  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  37.66 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  38.67 
 
 		 219 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2385  hypothetical protein  38.4 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  37.08 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1214  hypothetical protein  33.2 
 
 		 233 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.835454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  37.1 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0930  hypothetical protein  37.07 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572615  normal  0.581042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  33.19 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  35.29 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  34.76 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1950  hypothetical protein  37.14 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.530616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  34.48 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0287  hypothetical protein  37.61 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615178  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0861  hypothetical protein  37.61 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1003  hypothetical protein  37.61 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1316  hypothetical protein  37.14 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1165  hypothetical protein  37.61 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1156  hypothetical protein  37.18 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  34.35 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  35.92 
 
 		 289 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  34.13 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  33.48 
 
 		 204 aa  95.5  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  31.72 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0735  hypothetical protein  37.22 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  33.05 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  30.18 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  32.88 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0888  hypothetical protein  30.94 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5126  hypothetical protein  35.14 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal  0.929155 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2439  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872565  hitchhiker  0.00642281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  31.82 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  31.12 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  31.02 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2751  hypothetical protein  36.14 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  31.62 
 
 		 274 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  27.63 
 
 		 260 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>