30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4124 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4124  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158038  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4902  thioesterase-like  52.9 
 
 
165 aa  150  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3780  putative thioesterase  42.36 
 
 
149 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3100  thioesterase-like  37.32 
 
 
152 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51510  hypothetical protein  36.15 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000170599  hitchhiker  0.0000345324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  28 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  25.93 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2063  thioesterase-like  24.41 
 
 
314 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.529459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0674  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.61 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  22.05 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.13 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
146 aa  44.7  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
151 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.06 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  25.53 
 
 
152 aa  44.3  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
147 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  24.83 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.74 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.4 
 
 
150 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
150 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 
137 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
147 aa  41.2  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.38 
 
 
133 aa  41.2  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
137 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.58 
 
 
133 aa  40.8  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.05 
 
 
136 aa  40.4  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>