36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2798 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2798  transport-associated  100 
 
 		 277 aa  564  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549341  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  69.68 
 
 		 278 aa  401  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  27.51 
 
 		 273 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  28.15 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  26.02 
 
 		 275 aa  95.5  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  27.41 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  24.07 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  27.14 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  26.77 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  26.42 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  25.46 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  26.05 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  20.88 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2397  hypothetical protein  23.73 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  20.53 
 
 		 204 aa  49.3  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  26.88 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  28.08 
 
 		 209 aa  45.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  29.29 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  31.19 
 
 		 204 aa  45.8  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  31.19 
 
 		 204 aa  45.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  24.18 
 
 		 238 aa  45.8  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  31.19 
 
 		 204 aa  45.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  37.5 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  37.5 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  37.5 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  37.5 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  37.5 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  37.5 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  37.5 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  37.5 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  23.08 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  28.26 
 
 		 104 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  28.26 
 
 		 104 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  28.26 
 
 		 104 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  35.94 
 
 		 201 aa  43.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0368  transport-associated  40.58 
 
 		 107 aa  42.7  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>