34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2414 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2414  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  283  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2021  hypothetical protein  67.61 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3499  hypothetical protein  52.82 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2125  hypothetical protein  54.93 
 
 		 141 aa  141  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2963  hypothetical protein  54.23 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3258  hypothetical protein  57.24 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2737  hypothetical protein  53.9 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294707  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2253  hypothetical protein  52.11 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2763  hypothetical protein  52.11 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1926  hypothetical protein  51.43 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1885  hypothetical protein  48.95 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0298787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1363  protein of unknown function DUF107  42.45 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0778838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  37.59 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1320  hypothetical protein  41.18 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1422  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14104  decreased coverage  0.00104227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5311  hypothetical protein  35.97 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03679  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1299  protein of unknown function DUF107  42.45 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3278  NfeD family protein  35.25 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.829792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2414  NfeD family protein  35.25 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2469  NfeD family protein  35.25 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1305  NfeD family protein  35.25 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1534  hypothetical protein  35.25 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2034  NfeD family protein  35.25 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2560  nodulation efficiency protein D  35.25 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2034  hypothetical protein  38.52 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2047  hypothetical protein  34.53 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101752  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1903  hypothetical protein  37.7 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1275  hypothetical protein  37.7 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.815122 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2021  hypothetical protein  37.7 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1863  hypothetical protein  36.69 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6076  hypothetical protein  37.7 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2001  hypothetical protein  37.7 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.812205  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1700  hypothetical protein  38.06 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2437  protein of unknown function DUF107  36.57 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0086298  normal  0.0411134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>