18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1808 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1808  putative signal peptide protein  100 
 
 		 170 aa  339  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000025679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2779  putative signal peptide protein  75 
 
 		 172 aa  215  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881976  normal  0.0394345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1633  putative signal peptide protein  54.39 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2980  putative signal peptide protein  53.71 
 
 		 180 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1443  putative signal peptide protein  49.71 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3153  putative signal peptide protein  54.71 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1110  putative signal peptide protein  50 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1190  putative signal peptide protein  49.43 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.672558  normal  0.403432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5001  putative signal peptide protein  42.86 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2061  putative signal peptide protein  45.33 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00788966  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1259  putative signal peptide protein  45.58 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.617391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2056  putative signal peptide protein  44.03 
 
 		 188 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1087  conserved hypothetical signal peptide protein  42.67 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1180  putative signal peptide protein  42.67 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2075  putative signal peptide protein  39.16 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3582  putative signal peptide protein  41.72 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3649  hypothetical protein  35.81 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3762  hypothetical protein  28.67 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.118214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>