More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1376 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1376  rhodanese-like protein  100 
 
 
282 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1690  rhodanese domain-containing protein  54.74 
 
 
435 aa  304  9.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2476  rhodanese-like domain protein  55.51 
 
 
435 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1841  rhodanese-like domain-containing protein  55.51 
 
 
435 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1433  rhodanese-like domain-containing protein  55.51 
 
 
435 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.587223  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01726  predicted thiosulfate sulfur transferase  55.13 
 
 
435 aa  298  5e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.382784  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1885  Rhodanese domain protein  55.13 
 
 
435 aa  298  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01714  hypothetical protein  55.13 
 
 
435 aa  298  5e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.526406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2006  rhodanese-like domain protein  54.75 
 
 
428 aa  296  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1875  rhodanese domain-containing protein  54.75 
 
 
435 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1980  rhodanese-like domain-containing protein  54.75 
 
 
435 aa  296  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0372408  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1149  Rhodanese domain protein  41.25 
 
 
457 aa  194  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1308  Rhodanese domain protein  40.47 
 
 
430 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2110  Rhodanese domain protein  37.6 
 
 
324 aa  177  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1124  putative thiosulfate sulfurtransferase  37.69 
 
 
451 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.030225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1308  putative thiosulfate sulfurtransferase  37.69 
 
 
451 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.419981  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  31.56 
 
 
288 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  31.32 
 
 
280 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  28.95 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  31.92 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  30.42 
 
 
285 aa  92.4  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  27.74 
 
 
281 aa  92.4  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  31.23 
 
 
277 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  31.23 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  28.8 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  31.23 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  31.23 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  28.52 
 
 
286 aa  89.7  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  27.92 
 
 
281 aa  89  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  27.92 
 
 
281 aa  89  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  28.21 
 
 
277 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  29.25 
 
 
301 aa  89  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  28.99 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  29.32 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  26.97 
 
 
321 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  26.97 
 
 
321 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  29.89 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  27.31 
 
 
286 aa  85.9  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  31.15 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  28.41 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  27.68 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  31.37 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  30.38 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  30 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  30 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  30.24 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  29.5 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.34 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  28.25 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  27.37 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  24.91 
 
 
327 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  28.9 
 
 
319 aa  79  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  29.37 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  27.63 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  29.62 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.92 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  28.52 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  29.66 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  29.48 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  26.19 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  26.44 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  28.08 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  26.78 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.87 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  28.69 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  26.32 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  28.69 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  26.03 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  28.29 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  28.16 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.41 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.03 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  27.71 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  29.76 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  29.12 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  26.84 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  29.84 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  28.9 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  28.34 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  28.85 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  31.33 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  29.62 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  23.7 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  24.45 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1954  Rhodanese domain protein  26.45 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.535428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  28.85 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  25.74 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  28.63 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  26.74 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2817  Rhodanese domain protein  23.9 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0944  Rhodanese domain protein  22.65 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000021463  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  28.85 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.65 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  31.47 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  29.1 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>