64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5414 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5414  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
245 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4624  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  71.75 
 
 
237 aa  323  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213452  normal  0.986486 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1380  hypothetical protein  60.19 
 
 
238 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0411508  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1515  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  61.62 
 
 
241 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135527  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1169  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  61.62 
 
 
241 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0412  hypothetical protein  61.62 
 
 
241 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1429  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  61.62 
 
 
241 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0024  hypothetical protein  61.62 
 
 
238 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0131  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  61.62 
 
 
230 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2629  hypothetical protein  62.96 
 
 
221 aa  255  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  49.53 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0786  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43 
 
 
221 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2073  hypothetical protein  35.16 
 
 
214 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3015  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.5 
 
 
205 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2920  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.79 
 
 
205 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1870  hypothetical protein  40.85 
 
 
214 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536067  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2349  hypothetical protein  31.58 
 
 
206 aa  86.3  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0506  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  42.86 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255044  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.68 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.14 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 
210 aa  62.4  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.24 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4073  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.96 
 
 
224 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3999  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.96 
 
 
224 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147768  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.88 
 
 
227 aa  56.2  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11240  integral membrane protein  34.82 
 
 
224 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000124394  normal  0.0612998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2219  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.77 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0421811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  30.28 
 
 
153 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1442  hypothetical protein  36.59 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.75 
 
 
189 aa  49.3  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0017  hypothetical protein  36.59 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6241  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.35 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0013  hypothetical protein  36.59 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0016  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  36.59 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  31.25 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1162  hypothetical protein  36.59 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1520  hypothetical protein  36.59 
 
 
225 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.04 
 
 
202 aa  48.5  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  32.33 
 
 
189 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0015  hypothetical protein  37.8 
 
 
225 aa  48.5  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.698874  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.33 
 
 
189 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2639  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0018  hypothetical protein  36.71 
 
 
79 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294318  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.24 
 
 
196 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0193  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.18 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00375189  decreased coverage  0.000266905 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20970  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.43 
 
 
184 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.07 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.37 
 
 
230 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2709  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.71 
 
 
235 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.65 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2271  hypothetical protein  30.21 
 
 
476 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.25 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.18 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.03 
 
 
157 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.37 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.83 
 
 
191 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.18 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0945  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.53 
 
 
444 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  31.58 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.28 
 
 
218 aa  42.4  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.68 
 
 
219 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2029  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.59 
 
 
161 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000425437  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1695  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 
227 aa  42.4  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.14174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.45 
 
 
209 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>