More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5330 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  100 
 
 		 333 aa  673    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  87.39 
 
 		 331 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  74.22 
 
 		 316 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  63.2 
 
 		 301 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  62.55 
 
 		 302 aa  353  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  53.61 
 
 		 314 aa  322  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  61.69 
 
 		 323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  52.4 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  49.08 
 
 		 308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  53.96 
 
 		 305 aa  288  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  50.55 
 
 		 309 aa  286  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  49.28 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  48.08 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  51.3 
 
 		 310 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  49.82 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  47.02 
 
 		 317 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  49.63 
 
 		 305 aa  258  9e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  49.07 
 
 		 271 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  47.1 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  44.66 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  47.04 
 
 		 309 aa  248  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  46.67 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  46.79 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  46.79 
 
 		 305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  46.52 
 
 		 302 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  46.18 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  45.93 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  46.56 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  46.27 
 
 		 303 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  40.8 
 
 		 345 aa  235  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  46.18 
 
 		 304 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  46.35 
 
 		 277 aa  228  7e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 296 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  36.58 
 
 		 271 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  30.83 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0784  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.89 
 
 		 281 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.756682  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  32.68 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0138  aldo/keto reductase  29.74 
 
 		 279 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  28.68 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  26.62 
 
 		 274 aa  86.7  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  26.62 
 
 		 274 aa  86.7  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  26.52 
 
 		 281 aa  86.3  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  28.63 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  30.69 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1919  aldo/keto reductase  30.47 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2531  aldo/keto reductase  30.47 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  32.81 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2555  aldo/keto reductase  30.47 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324951 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  29.74 
 
 		 352 aa  82.4  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  30.86 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000271935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3732  aldo/keto reductase  29.06 
 
 		 273 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  31.56 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  28.04 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.36 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  29.39 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3173  aldo/keto reductase  29.66 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  31.15 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  30.71 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.27 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  31.44 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0755  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.88 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.181791  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.37 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.211606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  29.27 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  29.27 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2256  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.48 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  29.11 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  28.4 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  29.27 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  27.64 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1685  aldo/keto reductase  32.27 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0551  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.48 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2128  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.48 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.27 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  29.27 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  28.62 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  28.12 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  29.2 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.86 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0948  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.48 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1101  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.48 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.16541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  29.45 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5863  aldo/keto reductase  29.3 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  28.83 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0952  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.48 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  28.72 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2622  aldo/keto reductase  31.22 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  29.58 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3009  aldo/keto reductase  30.8 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0466908 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  26.28 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0764  aldo/keto reductase  32.58 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0414529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2881  aldo/keto reductase  29.09 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.97 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  30.45 
 
 		 280 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0142  aldo/keto reductase  25.88 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  27.22 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.46 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.97 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.97 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  27.72 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  26.42 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>