297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7775 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7744  HesB/YadR/YfhF-family protein  100 
 
 
132 aa  261  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7775  HesB/YadR/YfhF-family protein  100 
 
 
132 aa  261  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1447  HesB/YadR/YfhF  63.36 
 
 
135 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1576  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.41 
 
 
136 aa  142  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.717654  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1406  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.61 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0206  HesB/YadR/YfhF family protein  57.61 
 
 
127 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.178163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5902  putative iron-sulfur cluster assembly protein  56.25 
 
 
109 aa  106  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316321  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0961  HesB/YadR/YfhF  56.04 
 
 
118 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3644  HesB/YadR/YfhF-family protein  54.35 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0113  HesB/YadR/YfhF-family protein  52.75 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0398  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.95 
 
 
118 aa  94  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770041  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4470  HesB/YadR/YfhF  42.99 
 
 
118 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1065  HesB/YadR/YfhF  51.65 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5109  HesB/YadR/YfhF-family protein  43.93 
 
 
118 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.38 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1531  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.38 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.182474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  37.5 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  39.36 
 
 
106 aa  66.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.36 
 
 
106 aa  66.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.51 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.23 
 
 
106 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.96 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.74 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  35.11 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  36.73 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.44 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1111  HesB/YadR/YfhF-family protein  28.89 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  33.01 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  32.69 
 
 
168 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  35.71 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  34.95 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.58 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  33.01 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  32.04 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1343  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.69 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  32.04 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3155  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.63 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1566  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  30.77 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.58 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  32.04 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.71 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.29 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  33.67 
 
 
123 aa  53.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  32.04 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.19 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  32.98 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  38.71 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1859  HesB/YadR/YfhF  32.71 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1441  HesB/YadR/YfhF, Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  32.98 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0666522  hitchhiker  0.00534365 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.19 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.36 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  33.33 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  39.44 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.44 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.98 
 
 
130 aa  52  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.98 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.69 
 
 
119 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  37.88 
 
 
106 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.68 
 
 
116 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.69 
 
 
119 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.91 
 
 
123 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  31.07 
 
 
130 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.98 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2733  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.33 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.08 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1581  HesB/YadR/YfhF  32.69 
 
 
186 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617469  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  31.73 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.33 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.22 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.46 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1363  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.63 
 
 
107 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  31.37 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  32.22 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.78 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.07 
 
 
130 aa  50.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.78 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1958  FeS assembly scaffold SufA  35 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.63 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2134  hypothetical protein  32.63 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.191156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  31.37 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1900  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  35 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00343676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1765  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  35 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.718916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2398  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  35 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.63 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  30.39 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0466  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.11 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0234938  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1512  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  35 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613929  hitchhiker  0.00000225321 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2053  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.63 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.432369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1885  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  35 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.89 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  30.53 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.22 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.22 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  31.37 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.22 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  30.1 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.9 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>