83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4037 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  52.61 
 
 
337 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  52.42 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  44.37 
 
 
364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  53.39 
 
 
357 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  40.12 
 
 
352 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  45.24 
 
 
400 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  45.79 
 
 
366 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1642  hypothetical protein  46.46 
 
 
343 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118312  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1162  hypothetical protein  46.46 
 
 
343 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  51.25 
 
 
337 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  57.07 
 
 
205 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  40.41 
 
 
338 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  48.13 
 
 
337 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  52.27 
 
 
328 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4788  hypothetical protein  45.85 
 
 
344 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173815  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  42.86 
 
 
336 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  40.71 
 
 
338 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  47.62 
 
 
338 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  47.62 
 
 
338 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  46.89 
 
 
338 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  46.89 
 
 
338 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  41.72 
 
 
316 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1539  hypothetical protein  45.71 
 
 
341 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1617  hypothetical protein  46.15 
 
 
343 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00170035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1560  hypothetical protein  46.38 
 
 
341 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0159357  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  45.58 
 
 
339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  45.27 
 
 
380 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  45.34 
 
 
366 aa  215  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1596  hypothetical protein  45.99 
 
 
338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91747  hitchhiker  0.00122514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  44.16 
 
 
344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  43.35 
 
 
343 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  39.5 
 
 
315 aa  199  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  44.16 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  43.72 
 
 
316 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  43.72 
 
 
316 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  39.85 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  42.06 
 
 
349 aa  195  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  47.52 
 
 
347 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  42.49 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  42.73 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  40.18 
 
 
503 aa  179  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  37.29 
 
 
274 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  41.7 
 
 
354 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  40.31 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  36.52 
 
 
357 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  35.59 
 
 
925 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  42.64 
 
 
443 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  36.71 
 
 
443 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  31.11 
 
 
192 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  35.84 
 
 
195 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  31.52 
 
 
209 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
194 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  26.06 
 
 
813 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00758  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 
496 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  31.74 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  31.49 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  25.68 
 
 
810 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  29.83 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  25.43 
 
 
222 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  26.32 
 
 
244 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  26.32 
 
 
224 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  26.32 
 
 
244 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  30.27 
 
 
184 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1943  hypothetical protein  27.33 
 
 
199 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  28.78 
 
 
210 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  32.4 
 
 
191 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  30.5 
 
 
207 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  27.04 
 
 
203 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  28.95 
 
 
842 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  25.15 
 
 
192 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  24.55 
 
 
192 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  24.26 
 
 
189 aa  53.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  23.08 
 
 
447 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  28.09 
 
 
196 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1799  hypothetical protein  26.19 
 
 
223 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  28.57 
 
 
188 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  28.24 
 
 
188 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  29.82 
 
 
187 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4324  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  24.34 
 
 
205 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  22.99 
 
 
818 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  27.07 
 
 
209 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0198  IucA/IucC family protein  28.75 
 
 
209 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0130557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>