48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3925 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3925  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3924  glycosyl transferase family protein  42.56 
 
 
305 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0811  glycosyl transferase family 9  37.04 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513636  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
361 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
364 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  38.83 
 
 
302 aa  52.8  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
376 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
368 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  36.75 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
330 aa  49.3  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  30.37 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1611  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.66 
 
 
321 aa  47  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
402 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0749  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
331 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  32.11 
 
 
357 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0879  glycosyl transferase family 9  37.78 
 
 
327 aa  46.6  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000737815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  34.11 
 
 
381 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  34.11 
 
 
381 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  34.11 
 
 
381 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
317 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  34.11 
 
 
359 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  34.11 
 
 
359 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  34.11 
 
 
359 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0813  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278172 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  34.11 
 
 
359 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  33.04 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3193  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.558162  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.73 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  31.68 
 
 
381 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4512  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.11 
 
 
314 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.935025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  28.35 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.24 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1640  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.53 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  31.74 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1610  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.94 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.812323  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1066  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.33 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  28.95 
 
 
340 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 
516 aa  43.5  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2557  glycosyl transferase family protein  23.78 
 
 
376 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  31.31 
 
 
358 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0315  glycosyl transferase family 9  25.32 
 
 
343 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  32.74 
 
 
574 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1598  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.49 
 
 
314 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.07 
 
 
360 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>