More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0704 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3050  Beta-ketoacyl synthase  78.91 
 
 
413 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.243169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0941  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  80.89 
 
 
413 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0450403  normal  0.675739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0704  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
408 aa  825    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4775  Beta-ketoacyl synthase  67.34 
 
 
432 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.774629  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3698  Beta-ketoacyl synthase  67.34 
 
 
432 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551218 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0357  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  68.1 
 
 
404 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21868  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3612  beta-ketoacyl synthase  71.86 
 
 
412 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4087  Beta-ketoacyl synthase  70.27 
 
 
412 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519771  normal  0.894372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0998  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  52.85 
 
 
405 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000357653  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0453  Beta-ketoacyl synthase  52.99 
 
 
402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2879  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  52.61 
 
 
406 aa  398  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03137  beta-ketoacyl- synthase I  52.28 
 
 
394 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0456  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  51 
 
 
405 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3635  Beta-ketoacyl synthase  50.25 
 
 
408 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1373  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  50.5 
 
 
405 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0018  beta-ketoacyl synthase  51.61 
 
 
405 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.83399  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1422  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  48.38 
 
 
411 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484901  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1487  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  48.38 
 
 
411 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000399057  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1475  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  48.13 
 
 
411 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896879  normal  0.430163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03105  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  48.88 
 
 
403 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0526  beta-ketoacyl synthase  50.75 
 
 
407 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38393  normal  0.0451543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3807  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  48.13 
 
 
403 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3665  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  50 
 
 
405 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4242  Beta-ketoacyl synthase  49.63 
 
 
404 aa  378  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0417554  hitchhiker  0.0000000109477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2410  beta-ketoacyl synthase  48.38 
 
 
403 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000023213  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29060  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  50 
 
 
405 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1482  beta-ketoacyl synthase  49.13 
 
 
403 aa  381  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000201654  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase KASI  49.63 
 
 
403 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000108179  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1391  beta-ketoacyl synthase  48.26 
 
 
412 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  49.5 
 
 
405 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0542  Beta-ketoacyl synthase  50.75 
 
 
407 aa  378  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2154  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  48.88 
 
 
403 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000914217  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  47.63 
 
 
403 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1606  Beta-ketoacyl synthase  48.13 
 
 
424 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000886766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1693  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  48.38 
 
 
403 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000193384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3008  Beta-ketoacyl synthase  48.13 
 
 
403 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.753979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1274  Beta-ketoacyl synthase  49.75 
 
 
407 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1613  Beta-ketoacyl synthase  47.26 
 
 
411 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000687421  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2840  Beta-ketoacyl synthase  47.26 
 
 
411 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  decreased coverage  0.0000909271 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2746  beta-ketoacyl synthase  47.26 
 
 
411 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2160  beta-ketoacyl synthase  50.62 
 
 
410 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1644  beta-ketoacyl synthase  48.63 
 
 
403 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00348297  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2763  Beta-ketoacyl synthase  47.26 
 
 
411 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000380167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2684  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  49.26 
 
 
408 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376136  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4180  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  49.75 
 
 
408 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.310859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0612  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  49.27 
 
 
408 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0221  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.52 
 
 
408 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.188438 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01194  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  47.88 
 
 
404 aa  371  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1071  3-ketoacyl-ACP synthase FabB  47.01 
 
 
403 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.791562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2445  beta-ketoacyl synthase  46.77 
 
 
411 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000400584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1693  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.01 
 
 
406 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2210  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  47.39 
 
 
407 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0033  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.16 
 
 
407 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.77 
 
 
408 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413465  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1945  Beta-ketoacyl synthase  48.64 
 
 
406 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153136  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0041  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.16 
 
 
407 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0430  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.78 
 
 
408 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3498  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.01 
 
 
406 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2470  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.76 
 
 
406 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2019  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.39 
 
 
407 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383938  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4213  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.01 
 
 
406 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.409355  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1009  beta-ketoacyl synthase  48.77 
 
 
409 aa  365  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3746  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.76 
 
 
406 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0348  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.04 
 
 
408 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0180  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  49.01 
 
 
407 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0383  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.28 
 
 
408 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1995  beta-ketoacyl synthase  46.9 
 
 
404 aa  361  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.566366  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4175  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.51 
 
 
406 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40794  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1650  beta-ketoacyl synthase  49.01 
 
 
409 aa  360  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3938  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.14 
 
 
406 aa  359  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0053  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.9 
 
 
407 aa  358  7e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0495  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.89 
 
 
408 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0230579  normal  0.158439 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2585  Beta-ketoacyl synthase  47.26 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0740  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.78 
 
 
407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3148  beta-ketoacyl synthase  46.15 
 
 
403 aa  356  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0425  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.39 
 
 
408 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0458  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.39 
 
 
408 aa  354  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_004310  BR2172  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.67 
 
 
407 aa  353  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2084  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.67 
 
 
407 aa  353  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0068  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.6 
 
 
399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.707372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1777  Beta-ketoacyl synthase  48.15 
 
 
412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.290633  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3449  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.89 
 
 
406 aa  353  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2871  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.15 
 
 
405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.261855  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1899  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  46.23 
 
 
411 aa  350  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.126696 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2618  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.9 
 
 
406 aa  351  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3464  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.9 
 
 
406 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3383  beta-ketoacyl synthase  46.88 
 
 
404 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.160836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02248  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  47.65 
 
 
406 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1333  Beta-ketoacyl synthase  47.65 
 
 
406 aa  349  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2480  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.65 
 
 
406 aa  349  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02208  hypothetical protein  47.65 
 
 
406 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1329  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.65 
 
 
406 aa  349  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318375  normal  0.654586 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2474  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.65 
 
 
406 aa  349  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1359  Beta-ketoacyl synthase  46.78 
 
 
406 aa  350  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.272883  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1269  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  46.29 
 
 
406 aa  349  6e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2205  Beta-ketoacyl synthase  46.42 
 
 
407 aa  348  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2701  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  47.41 
 
 
406 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2805  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  45.91 
 
 
405 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.858118  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2518  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.02 
 
 
404 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2620  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  48.02 
 
 
404 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  hitchhiker  0.0000202804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>