More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1329 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02248  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  100 
 
 
406 aa  834    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1333  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
406 aa  834    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1329  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  100 
 
 
406 aa  834    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318375  normal  0.654586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1520  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  85.01 
 
 
407 aa  690    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1359  Beta-ketoacyl synthase  88.59 
 
 
406 aa  752    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.272883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0371  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  85.26 
 
 
407 aa  690    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160641  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3368  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  87.41 
 
 
404 aa  709    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000210854  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2480  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  100 
 
 
406 aa  834    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2620  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  96.78 
 
 
404 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  hitchhiker  0.0000202804 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2474  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  100 
 
 
406 aa  834    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1459  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  93.07 
 
 
405 aa  775    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0426777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2567  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  96.53 
 
 
404 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.926169  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3464  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  99.75 
 
 
406 aa  833    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2607  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  96.53 
 
 
404 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.883594  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02208  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  834    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2518  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  96.53 
 
 
404 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2585  Beta-ketoacyl synthase  87.9 
 
 
405 aa  737    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2731  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  96.78 
 
 
404 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.21582  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2871  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  92.35 
 
 
405 aa  764    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.261855  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2805  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  93.32 
 
 
405 aa  778    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.858118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1411  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  85.01 
 
 
407 aa  690    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000034397  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2701  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  99.75 
 
 
406 aa  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2618  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  99.75 
 
 
406 aa  833    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1693  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  75.06 
 
 
403 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000193384  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0665  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  72.66 
 
 
406 aa  604  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.956825  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03105  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  73.58 
 
 
403 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2410  beta-ketoacyl synthase  71.85 
 
 
403 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000023213  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1071  3-ketoacyl-ACP synthase FabB  72.35 
 
 
403 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.791562  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0362  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase  72.41 
 
 
406 aa  597  1e-170  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase KASI  72.84 
 
 
403 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000108179  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1422  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  70.62 
 
 
411 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484901  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1487  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  70.37 
 
 
411 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000399057  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1475  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  70.37 
 
 
411 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896879  normal  0.430163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  70.37 
 
 
403 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2154  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  70.37 
 
 
403 aa  591  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000914217  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2840  Beta-ketoacyl synthase  69.88 
 
 
411 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  decreased coverage  0.0000909271 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2445  beta-ketoacyl synthase  70.12 
 
 
411 aa  589  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000400584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1613  Beta-ketoacyl synthase  69.88 
 
 
411 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000687421  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3383  beta-ketoacyl synthase  73.58 
 
 
404 aa  588  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.160836  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2746  beta-ketoacyl synthase  69.88 
 
 
411 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01194  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  70.97 
 
 
404 aa  586  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1606  Beta-ketoacyl synthase  69.14 
 
 
424 aa  585  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000886766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1391  beta-ketoacyl synthase  69.63 
 
 
412 aa  586  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3807  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  71.36 
 
 
403 aa  582  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2763  Beta-ketoacyl synthase  69.63 
 
 
411 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000380167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1482  beta-ketoacyl synthase  69.38 
 
 
403 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000201654  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1995  beta-ketoacyl synthase  70.62 
 
 
404 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.566366  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1644  beta-ketoacyl synthase  70.12 
 
 
403 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00348297  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3008  Beta-ketoacyl synthase  69.63 
 
 
403 aa  570  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.753979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3665  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.7 
 
 
405 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0456  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  69.04 
 
 
405 aa  566  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.46 
 
 
405 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2470  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.55 
 
 
406 aa  553  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4242  Beta-ketoacyl synthase  67.08 
 
 
404 aa  548  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0417554  hitchhiker  0.0000000109477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29060  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.21 
 
 
405 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4213  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  66.75 
 
 
406 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.409355  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1373  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  65.84 
 
 
405 aa  545  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3498  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  67.08 
 
 
406 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4175  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  66.75 
 
 
406 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40794  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1945  Beta-ketoacyl synthase  68.8 
 
 
406 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1693  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  66.5 
 
 
406 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1893  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  66.91 
 
 
407 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3746  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  66.75 
 
 
406 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2019  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  67.16 
 
 
407 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383938  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0018  beta-ketoacyl synthase  65.43 
 
 
405 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.83399  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2210  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  66.91 
 
 
407 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0998  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  65.43 
 
 
405 aa  528  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000357653  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0453  Beta-ketoacyl synthase  63.86 
 
 
402 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2879  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  63.95 
 
 
406 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1777  Beta-ketoacyl synthase  64.62 
 
 
412 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.290633  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0180  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.38 
 
 
407 aa  511  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0983  Beta-ketoacyl synthase  64.29 
 
 
405 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.521852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4180  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  61.44 
 
 
408 aa  498  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.310859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1274  Beta-ketoacyl synthase  60.15 
 
 
407 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0526  beta-ketoacyl synthase  60.89 
 
 
407 aa  497  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38393  normal  0.0451543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3635  Beta-ketoacyl synthase  61.82 
 
 
408 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3449  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.88 
 
 
406 aa  494  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0542  Beta-ketoacyl synthase  60.89 
 
 
407 aa  497  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3938  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.88 
 
 
406 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0041  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.9 
 
 
407 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3148  beta-ketoacyl synthase  60.25 
 
 
403 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0033  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.92 
 
 
407 aa  489  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4379  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  59.46 
 
 
410 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.913826 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03137  beta-ketoacyl- synthase I  62.12 
 
 
394 aa  490  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4057  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  59.95 
 
 
410 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1899  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  61.17 
 
 
411 aa  487  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.126696 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2189  beta-ketoacyl synthase  61.41 
 
 
411 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61286  normal  0.0115255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0332  Beta-ketoacyl synthase  61.67 
 
 
407 aa  485  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal  0.207835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0053  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.69 
 
 
407 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0612  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.76 
 
 
408 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2172  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.29 
 
 
407 aa  478  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2160  beta-ketoacyl synthase  60.74 
 
 
410 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0740  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.03 
 
 
407 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2205  Beta-ketoacyl synthase  61.18 
 
 
407 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2084  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.29 
 
 
407 aa  478  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0221  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.27 
 
 
408 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.188438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5061  Beta-ketoacyl synthase  61.63 
 
 
404 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.390685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0430  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.12 
 
 
408 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1269  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  59.85 
 
 
406 aa  476  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  60.1 
 
 
404 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>