More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2840 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2763  Beta-ketoacyl synthase  98.54 
 
 
411 aa  838    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000380167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  94.54 
 
 
403 aa  800    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2445  beta-ketoacyl synthase  99.03 
 
 
411 aa  846    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000400584  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1606  Beta-ketoacyl synthase  87.84 
 
 
424 aa  743    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000886766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1693  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  74.94 
 
 
403 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000193384  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03105  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  76.18 
 
 
403 aa  657    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1613  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
411 aa  852    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000687421  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1482  beta-ketoacyl synthase  91.07 
 
 
403 aa  771    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000201654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2746  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
411 aa  852    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1422  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  95.38 
 
 
411 aa  820    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484901  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1487  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  95.62 
 
 
411 aa  822    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000399057  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1391  beta-ketoacyl synthase  90.75 
 
 
412 aa  780    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase KASI  75.19 
 
 
403 aa  653    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000108179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3008  Beta-ketoacyl synthase  89.08 
 
 
403 aa  731    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.753979 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1071  3-ketoacyl-ACP synthase FabB  74.69 
 
 
403 aa  644    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.791562  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1475  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  95.13 
 
 
411 aa  819    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896879  normal  0.430163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2410  beta-ketoacyl synthase  89.83 
 
 
403 aa  756    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000023213  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1644  beta-ketoacyl synthase  89.83 
 
 
403 aa  736    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00348297  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2840  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
411 aa  852    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  decreased coverage  0.0000909271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2154  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  90.82 
 
 
403 aa  773    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000914217  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01194  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  72.95 
 
 
404 aa  629  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3807  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  72.7 
 
 
403 aa  620  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1995  beta-ketoacyl synthase  69.98 
 
 
404 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.566366  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3383  beta-ketoacyl synthase  73.45 
 
 
404 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.160836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2470  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.73 
 
 
406 aa  592  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3665  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.31 
 
 
405 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1373  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  67.74 
 
 
405 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.31 
 
 
405 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02248  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  69.88 
 
 
406 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1333  Beta-ketoacyl synthase  69.88 
 
 
406 aa  588  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4175  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.55 
 
 
406 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40794  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1693  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.55 
 
 
406 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02208  hypothetical protein  69.88 
 
 
406 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3746  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.55 
 
 
406 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3464  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  70.12 
 
 
406 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2585  Beta-ketoacyl synthase  69.63 
 
 
405 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1329  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.88 
 
 
406 aa  588  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318375  normal  0.654586 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2618  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  70.12 
 
 
406 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29060  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.8 
 
 
405 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2480  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.88 
 
 
406 aa  588  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2474  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.88 
 
 
406 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2871  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.63 
 
 
405 aa  584  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.261855  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4213  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  68.56 
 
 
406 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.409355  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2701  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.63 
 
 
406 aa  586  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3498  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.48 
 
 
406 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1359  Beta-ketoacyl synthase  69.31 
 
 
406 aa  586  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.272883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1459  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  70.05 
 
 
405 aa  585  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0426777  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0665  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  68.89 
 
 
406 aa  587  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.956825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2805  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.8 
 
 
405 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.858118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0371  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  70.44 
 
 
407 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160641  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1520  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  70.44 
 
 
407 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339605  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1411  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  70.44 
 
 
407 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000034397  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2210  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  69.06 
 
 
407 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349846  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2019  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  68.81 
 
 
407 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383938  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4242  Beta-ketoacyl synthase  68.49 
 
 
404 aa  578  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0417554  hitchhiker  0.0000000109477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3368  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  70.47 
 
 
404 aa  579  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000210854  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2879  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  67.82 
 
 
406 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1945  Beta-ketoacyl synthase  70.86 
 
 
406 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153136  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2731  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.8 
 
 
404 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.21582  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2607  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.8 
 
 
404 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.883594  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2567  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.8 
 
 
404 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.926169  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2620  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.8 
 
 
404 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  hitchhiker  0.0000202804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2518  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.8 
 
 
404 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0456  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  66.58 
 
 
405 aa  564  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0018  beta-ketoacyl synthase  65.76 
 
 
405 aa  558  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.83399  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0998  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  65.26 
 
 
405 aa  560  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000357653  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1893  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  67.99 
 
 
407 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1777  Beta-ketoacyl synthase  64.53 
 
 
412 aa  537  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.290633  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0983  Beta-ketoacyl synthase  66.09 
 
 
405 aa  537  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.521852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0612  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  64.29 
 
 
408 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0542  Beta-ketoacyl synthase  63.18 
 
 
407 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0526  beta-ketoacyl synthase  63.18 
 
 
407 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38393  normal  0.0451543 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2084  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.56 
 
 
407 aa  531  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2172  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.56 
 
 
407 aa  531  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0041  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  63.46 
 
 
407 aa  531  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0740  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.81 
 
 
407 aa  531  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3635  Beta-ketoacyl synthase  63.3 
 
 
408 aa  531  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1274  Beta-ketoacyl synthase  61.19 
 
 
407 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0033  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.47 
 
 
407 aa  527  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0221  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  63.05 
 
 
408 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.188438 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0362  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase  62.69 
 
 
406 aa  524  1e-148  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3148  beta-ketoacyl synthase  62.94 
 
 
403 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0430  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.16 
 
 
408 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0348  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.22 
 
 
408 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0068  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  63.8 
 
 
399 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.707372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0053  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.03 
 
 
407 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1009  beta-ketoacyl synthase  63.88 
 
 
409 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2205  Beta-ketoacyl synthase  62.53 
 
 
407 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0453  Beta-ketoacyl synthase  60.35 
 
 
402 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3938  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.64 
 
 
406 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0458  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.62 
 
 
408 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.62 
 
 
408 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413465  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0383  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.13 
 
 
408 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0332  Beta-ketoacyl synthase  61.79 
 
 
407 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal  0.207835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4180  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  61.6 
 
 
408 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.310859 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1269  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.25 
 
 
406 aa  511  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0495  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.13 
 
 
408 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0230579  normal  0.158439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0425  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.13 
 
 
408 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1650  beta-ketoacyl synthase  61.03 
 
 
409 aa  510  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2160  beta-ketoacyl synthase  62.78 
 
 
410 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>