More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0634 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0634  ribosomal protein S15  100 
 
 
89 aa  180  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0964  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  114  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  58.43 
 
 
89 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0993  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.163035  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2831  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926546  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 
89 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1010  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.876313  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  110  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3414  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.350426  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1131  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00579414  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3277  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3236  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0824  ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  59.76 
 
 
87 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2824  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.103503  hitchhiker  0.00366524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1698  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1029  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.553716  hitchhiker  0.000000919084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1094  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0213931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1033  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236683  hitchhiker  0.0000205834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3057  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1207  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3558  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01764  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  105  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00913478  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  55.06 
 
 
89 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3386  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388546 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  57.47 
 
 
88 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0628  ribosomal protein S15  53.93 
 
 
101 aa  105  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  54.55 
 
 
95 aa  104  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  104  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>