26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0060 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0060  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  267  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0010  GspC  84.56 
 
 
136 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2783  general secretion pathway protein C  83.82 
 
 
136 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2665  general secretion pathway protein C  83.82 
 
 
136 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0010  general secretion pathway protein C  83.82 
 
 
136 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0010  general secretion pathway protein C  83.82 
 
 
136 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1887  general secretion pathway protein C  83.82 
 
 
136 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.730387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3515  general secretion pathway protein C  83.82 
 
 
136 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0223  GspC  83.82 
 
 
136 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850985  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0011  hypothetical protein  91.18 
 
 
136 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0059  hypothetical protein  91.18 
 
 
136 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157484  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0049  general secretion pathway protein C  88.97 
 
 
136 aa  218  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0078  hypothetical protein  92.65 
 
 
136 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0059  general secretion pathway protein C  89.71 
 
 
136 aa  197  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3241  hypothetical protein  88.97 
 
 
136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3939  putative general secretory pathway protein C  61.31 
 
 
140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4498  putative general secretory pathway protein C  61.31 
 
 
140 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.133212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3073  putative general secretory pathway protein C  57.66 
 
 
140 aa  155  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3381  hypothetical protein  44.7 
 
 
204 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3390  putative general secretion pathway related transmembrane protein  49.25 
 
 
227 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3043  putative general secretion pathway related transmembrane protein  48.18 
 
 
227 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429926  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3218  hypothetical protein  46.09 
 
 
229 aa  90.5  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1072  hypothetical protein  50.56 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904163  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3105  putative general secretion pathway related transmembrane protein  43.94 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79717  normal  0.98729 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1901  putative general secretion pathway related transmembrane protein  41.18 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4163  hypothetical protein  36.21 
 
 
177 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.962185  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>