35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3214 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  47.02 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  50 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  43.62 
 
 		 177 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  42.11 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  43.05 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  37.64 
 
 		 196 aa  92  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  48.31 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  37.93 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  39.23 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  44.52 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  38.05 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  40.37 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  32.79 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  37.11 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  36.96 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  28.44 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  30 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  30.92 
 
 		 172 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  27.52 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  28.57 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  27.43 
 
 		 314 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  33.96 
 
 		 155 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  28.85 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  28.9 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  29.84 
 
 		 180 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  29.84 
 
 		 180 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  30.53 
 
 		 171 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  29.51 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  34.29 
 
 		 280 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  26.61 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  27.16 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  28.04 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  31.43 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>