25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1257 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1257  regulatory protein TetR  100 
 
 		 246 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0471441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  66.81 
 
 		 242 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1361  regulatory protein TetR  55.76 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.560408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0882  regulatory protein TetR  57.5 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4023  putative transcriptional regulator, TetR family  55.39 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332964  normal  0.373488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3768  TetR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 257 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4062  TetR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4945  TetR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000126171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2539  TetR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2266  regulatory protein TetR  43.23 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1098  hypothetical protein  37.64 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0154  hypothetical protein  35.06 
 
 		 217 aa  98.6  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3282  hypothetical protein  36.69 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0678  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6153  regulatory protein TetR  25.14 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2820  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1141  hypothetical protein  26.49 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1136  hypothetical protein  26.49 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 194 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 220 aa  42  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>