26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29080 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_29080  Protein of unknown function (DUF993)  100 
 
 
428 aa  849    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192075  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2178  protein of unknown function DUF993  51.33 
 
 
404 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000897732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2424  hypothetical protein  51.09 
 
 
404 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2854  hypothetical protein  51.58 
 
 
390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3366  protein of unknown function DUF993  50 
 
 
422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.101266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2018  protein of unknown function DUF993  49.64 
 
 
386 aa  338  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6725  hypothetical protein  51.8 
 
 
376 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391855  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1078  hypothetical protein  50.92 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2458  hypothetical protein  50.12 
 
 
388 aa  322  7e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21472  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1857  protein of unknown function DUF993  48.55 
 
 
395 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1087  protein of unknown function DUF993  49.74 
 
 
406 aa  316  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0186844  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1720  hypothetical protein  48.43 
 
 
388 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200731  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4008  hypothetical protein  50.68 
 
 
380 aa  304  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3176  hypothetical protein  44.47 
 
 
389 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0139  hypothetical protein  47.61 
 
 
358 aa  298  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1972  hypothetical protein  42.93 
 
 
389 aa  296  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0814948  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0869  hypothetical protein  43.03 
 
 
389 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3332  hypothetical protein  47.53 
 
 
387 aa  293  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_004310  BR2050  hypothetical protein  42.45 
 
 
389 aa  292  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3580  hypothetical protein  45.77 
 
 
394 aa  289  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0148558  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4177  protein of unknown function DUF993  43.56 
 
 
389 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455034  decreased coverage  0.000150166 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1106  protein of unknown function DUF993  44.23 
 
 
387 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4012  protein of unknown function DUF993  42.86 
 
 
387 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4341  protein of unknown function DUF993  43.58 
 
 
387 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0569114  decreased coverage  0.00000104757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3928  hypothetical protein  42.51 
 
 
387 aa  262  8e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0648  protein of unknown function DUF993  44.33 
 
 
388 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>