22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25720 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_25720  Protein of unknown function (DUF2516)  100 
 
 		 105 aa  199  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  43.96 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  44.23 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.311832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  44.21 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  42.86 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  39.8 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05000  Protein of unknown function (DUF2516)  47.92 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  38.54 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3084  Protein of unknown function DUF2516  42.86 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  38.3 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  35.05 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  41 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03620  Protein of unknown function (DUF2516)  32.43 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.693043  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03700  hypothetical protein  43.75 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00236427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  36.78 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  38.89 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  32.98 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  32.35 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  37.18 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  34 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  32.38 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0099  hypothetical protein  41.51 
 
 		 108 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0513827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>