39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24940 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_24940  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 512 aa  1008    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1833  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 376 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5877  dehydrogenase-like protein  29.62 
 
 		 355 aa  113  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00938562  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1716  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 		 314 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  0.303463 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  26.95 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0050  oxidoreductase domain-containing protein  26.46 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  22.08 
 
 		 358 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  24.52 
 
 		 367 aa  54.3  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  29.48 
 
 		 337 aa  53.5  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  28.32 
 
 		 337 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  27.78 
 
 		 367 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11260  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 349 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.305619  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 360 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  23.66 
 
 		 308 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  23.88 
 
 		 359 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  23.88 
 
 		 359 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.48 
 
 		 308 aa  47.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  33.58 
 
 		 334 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.48 
 
 		 308 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  29.58 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  26.92 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1256  oxidoreductase domain-containing protein  31.61 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0579  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  22.02 
 
 		 355 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.19 
 
 		 308 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  22.66 
 
 		 347 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.9 
 
 		 308 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 		 468 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  28.29 
 
 		 346 aa  45.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  27.21 
 
 		 338 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  22 
 
 		 348 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 352 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  22.9 
 
 		 308 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  26.67 
 
 		 337 aa  44.3  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  28.37 
 
 		 362 aa  43.5  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  25.55 
 
 		 385 aa  43.5  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 		 435 aa  43.5  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 		 435 aa  43.5  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>