20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15110 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_15110  NUDIX family protein  100 
 
 
153 aa  297  3e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  27.82 
 
 
151 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  27.82 
 
 
151 aa  47  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
156 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 
193 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0265  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
200 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.306188  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 
157 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
175 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  30.21 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
169 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>