More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06860 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06860  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  100 
 
 		 328 aa  634    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0708364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  56.84 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.83 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  53.33 
 
 		 330 aa  328  6e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.68 
 
 		 327 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  50.76 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  52.57 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.1 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  53.82 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.14 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  55.45 
 
 		 328 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.89 
 
 		 328 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.61 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  51.96 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  51.71 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  51.71 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.71 
 
 		 328 aa  315  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.15 
 
 		 327 aa  315  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.17 
 
 		 325 aa  315  9e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.73 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  53.5 
 
 		 326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  52.28 
 
 		 328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.86 
 
 		 345 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  50.78 
 
 		 326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  53.11 
 
 		 326 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.16 
 
 		 326 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.27 
 
 		 327 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  54.08 
 
 		 326 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  52.72 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  51.09 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.36 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  51.52 
 
 		 329 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.41 
 
 		 327 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  50.78 
 
 		 326 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.46 
 
 		 328 aa  308  8e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  51.09 
 
 		 326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  54.08 
 
 		 327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 		 327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  50.16 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.36 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  51.91 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.09 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  49.84 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  53.33 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  51.52 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.02 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  52.28 
 
 		 327 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  53.08 
 
 		 338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  54.98 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  52.73 
 
 		 326 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.09 
 
 		 329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  51.52 
 
 		 329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  52.4 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.32 
 
 		 338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  52.73 
 
 		 326 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.41 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0901  alcohol dehydrogenase  51.06 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.03 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 		 330 aa  298  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  49.22 
 
 		 326 aa  298  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  51.81 
 
 		 327 aa  298  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  54.52 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.6 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1248  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.82 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1893  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.3 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.71 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  51.15 
 
 		 326 aa  295  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  50.92 
 
 		 327 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  47.99 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.41 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  54.41 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  51.21 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.21 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  51.21 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.15 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  52.15 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  50.91 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  50.91 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  50.91 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.92 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  51.38 
 
 		 330 aa  292  7e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.7 
 
 		 325 aa  291  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  50.91 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  50.91 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.21 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00543509 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  50.61 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.16 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  53.07 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  50.76 
 
 		 327 aa  287  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.7 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  50.31 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  53.03 
 
 		 332 aa  286  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0318941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  52.55 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  51.53 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.13 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  53.48 
 
 		 738 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>