24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05760 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  100 
 
 
69 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  58.06 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1573  hypothetical protein  54.84 
 
 
75 aa  63.5  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  48.44 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0644  hypothetical protein  54.24 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.624559  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  58.93 
 
 
75 aa  57  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1963  hypothetical protein  46.38 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.435104  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0858  hypothetical protein  53.33 
 
 
71 aa  51.2  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.228547  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  45 
 
 
67 aa  50.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  45.45 
 
 
58 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  50 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0619  hypothetical protein  45 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1630  CsbD family protein  52.17 
 
 
65 aa  43.5  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4486  CsbD family protein  33.33 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  35 
 
 
60 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  41.67 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0833  hypothetical protein  43.4 
 
 
79 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000181755  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  39.29 
 
 
56 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  36.92 
 
 
67 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  50 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  44.83 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5261  hypothetical protein  36.67 
 
 
60 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.197207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  40 
 
 
60 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0606  hypothetical protein  41.38 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.306362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>