66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6766 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6766  Hydantoin racemase-like protein  100 
 
 
276 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1413  Hydantoin racemase-like protein  32.43 
 
 
262 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  30.94 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  28.24 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  30.14 
 
 
243 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  28.76 
 
 
258 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4489  hypothetical protein  28.57 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  26.36 
 
 
232 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  29.72 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4863  Hydantoin racemase-like protein  26.73 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  normal  0.546582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.57 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6268  Asp/Glu/hydantoin racemase  21.95 
 
 
262 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  26.79 
 
 
243 aa  55.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  32.24 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.57 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  31.55 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  28.93 
 
 
250 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.28 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3252  hypothetical protein  26.51 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  30.59 
 
 
288 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.59 
 
 
288 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  29.77 
 
 
263 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  27.96 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.79 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  26.51 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.64 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2031  putative hydantoin racemase  29.81 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  28.14 
 
 
247 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  29.3 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.37 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  29.3 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.3 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.17 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  29.3 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.18 
 
 
285 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.3 
 
 
263 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.97 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.79 
 
 
247 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  27.78 
 
 
247 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.07 
 
 
256 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  29.38 
 
 
243 aa  48.9  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  27.93 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  27.93 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  27.93 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  27.93 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  27.93 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  27.93 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  28.02 
 
 
240 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  28.02 
 
 
240 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4294  Asp/Glu racemase  29.38 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  27.32 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  28.24 
 
 
287 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.32 
 
 
240 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  28.78 
 
 
243 aa  45.8  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  26.72 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  25.1 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1409  Asp/Glu racemase  24.86 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0168107  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1965  hypothetical protein  24.32 
 
 
245 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0199  Hydantoin racemase-like  27.23 
 
 
264 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.77 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2261  racemase, putative  25.7 
 
 
238 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113318  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.14 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3417  Asp/Glu racemase  27.16 
 
 
252 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0677  putative hydantoin racemase protein  32.52 
 
 
253 aa  42.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0966453  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.78 
 
 
250 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1959  hypothetical protein  23.78 
 
 
245 aa  42.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>