44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0199 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0199  Hydantoin racemase-like  100 
 
 		 264 aa  530  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4489  hypothetical protein  31.47 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3252  hypothetical protein  28.57 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  32.57 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1413  Hydantoin racemase-like protein  25.22 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6766  Hydantoin racemase-like protein  27.23 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  29.41 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.77 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.14 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  29.35 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  29.1 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  29.93 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.88 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  34.78 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.85 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4294  Asp/Glu racemase  29.45 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.02 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.82 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  27.17 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  26.67 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  26.67 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  26.67 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2031  putative hydantoin racemase  29.55 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1959  hypothetical protein  23.78 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.78 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1965  hypothetical protein  23.78 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  28.25 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3417  Asp/Glu racemase  28.17 
 
 		 252 aa  45.4  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  27.17 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  24.37 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.43 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.23 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.89 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  27.31 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  25.89 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  25.15 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  25.77 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  27.31 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.07 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.07 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  25.89 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  25.89 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0971  Asp/Glu racemase  28.75 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0912948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  26.03 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>