223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3859 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  100 
 
 
398 aa  800    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  72.89 
 
 
379 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  73.47 
 
 
409 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  73.47 
 
 
409 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  70.97 
 
 
422 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  67.44 
 
 
387 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  67.44 
 
 
387 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  67.44 
 
 
387 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  67.44 
 
 
387 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  69.07 
 
 
373 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  68.78 
 
 
378 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  69.07 
 
 
373 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  68.62 
 
 
388 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  58.58 
 
 
397 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  50.97 
 
 
363 aa  344  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  47.89 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  44.65 
 
 
397 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  44.65 
 
 
390 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  45.41 
 
 
408 aa  279  8e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  41.6 
 
 
389 aa  277  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  40.77 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  41.34 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  40.34 
 
 
410 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  40 
 
 
419 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  37.67 
 
 
388 aa  260  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  36.67 
 
 
390 aa  259  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  38.92 
 
 
410 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0950  polysaccharide export protein  40 
 
 
394 aa  256  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  37.3 
 
 
388 aa  255  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  37.8 
 
 
390 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  37.67 
 
 
388 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  37.53 
 
 
417 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  36.96 
 
 
404 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  35.31 
 
 
440 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  32.64 
 
 
396 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  33.42 
 
 
400 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  34.55 
 
 
410 aa  210  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  36.17 
 
 
402 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  35.22 
 
 
386 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  39.6 
 
 
440 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2079  polysaccharide export protein  35.54 
 
 
394 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.238275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  35.08 
 
 
391 aa  193  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  33.69 
 
 
406 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  30.51 
 
 
422 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  30.26 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  34.23 
 
 
387 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  32.41 
 
 
385 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  32.79 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  32.69 
 
 
378 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  32.69 
 
 
378 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  33.24 
 
 
377 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  33.52 
 
 
375 aa  156  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  32.34 
 
 
406 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  31.71 
 
 
365 aa  153  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  30.67 
 
 
395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  31.19 
 
 
392 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  29.43 
 
 
356 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.03 
 
 
386 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  25.77 
 
 
379 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  25.77 
 
 
379 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  25.77 
 
 
379 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.77 
 
 
379 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.03 
 
 
386 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.77 
 
 
386 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  25.52 
 
 
379 aa  123  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  26.34 
 
 
378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  27.3 
 
 
379 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.18 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  26.32 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  28.21 
 
 
398 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  29.17 
 
 
360 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3905  polysaccharide export protein  27.67 
 
 
354 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.132595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  25.87 
 
 
379 aa  106  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  24.74 
 
 
377 aa  106  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  25.13 
 
 
379 aa  106  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  25.13 
 
 
379 aa  106  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.13 
 
 
379 aa  106  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.13 
 
 
379 aa  106  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  25.13 
 
 
379 aa  106  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.13 
 
 
379 aa  106  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.13 
 
 
379 aa  106  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  25.13 
 
 
379 aa  106  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  27.05 
 
 
376 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  26.28 
 
 
378 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.84 
 
 
379 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.84 
 
 
379 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.84 
 
 
351 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.84 
 
 
348 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.84 
 
 
348 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  25.19 
 
 
387 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  25.19 
 
 
387 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  25.19 
 
 
392 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.12 
 
 
375 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  24.68 
 
 
393 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  25.41 
 
 
362 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  25.25 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  26.01 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  25.34 
 
 
317 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  25.13 
 
 
381 aa  96.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>