More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6627 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  98.66 
 
 
299 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  98.66 
 
 
299 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  86.96 
 
 
299 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  88.96 
 
 
298 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  88.63 
 
 
298 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.43 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  50 
 
 
314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.12 
 
 
301 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.78 
 
 
301 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  41.58 
 
 
291 aa  192  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  37.87 
 
 
303 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  37.87 
 
 
303 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  43.73 
 
 
298 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  38.77 
 
 
287 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  37.04 
 
 
304 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  38.22 
 
 
304 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  36.67 
 
 
304 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  37.63 
 
 
287 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  38.22 
 
 
304 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  38.43 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  35.93 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  37.84 
 
 
304 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  39.93 
 
 
287 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2709  EamA family protein  36.84 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00270641  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0094  hypothetical protein  32.09 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0098  hypothetical protein  32.09 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  35.82 
 
 
319 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  36.39 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.56 
 
 
294 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  32.2 
 
 
312 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  34.64 
 
 
327 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  32.35 
 
 
331 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 
340 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182068 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  30.47 
 
 
296 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  32.23 
 
 
299 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4101  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.86 
 
 
309 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.04 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  30.91 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  30 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.84 
 
 
356 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.96 
 
 
292 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  32.51 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  32.44 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  35.27 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2821  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.87 
 
 
342 aa  86.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.499218  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 
335 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  32.54 
 
 
316 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  27.9 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  27.3 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  27.3 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  27.3 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  28.11 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.42 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  30.11 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  27.46 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  26.95 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  26.5 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  26.76 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  27.7 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  27.3 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  27.56 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  32.26 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  28.9 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.29 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.24 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  27.76 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  28.11 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  25.46 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.09 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  25.81 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  25.38 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  30.48 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  30.85 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  31.32 
 
 
330 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
287 aa  77  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  31.69 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.15 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  29.87 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.55 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  30.41 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.06 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  33.21 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  33.21 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  33.21 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  32.08 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  31.02 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  28.73 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  30.56 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  30.5 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  30.32 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  26.67 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.99 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>