24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4886 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4886  hypothetical protein  100 
 
 		 54 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3278  hypothetical protein  100 
 
 		 54 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0873047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  81.08 
 
 		 515 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  78.38 
 
 		 512 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  81.08 
 
 		 512 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  78.38 
 
 		 513 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  78.38 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  83.78 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  78.38 
 
 		 505 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  78.38 
 
 		 505 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  81.08 
 
 		 512 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  75.68 
 
 		 512 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  78.38 
 
 		 462 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  75.68 
 
 		 512 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  75.68 
 
 		 512 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  75.68 
 
 		 510 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  75.68 
 
 		 512 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  75.68 
 
 		 533 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  75.68 
 
 		 512 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  72.97 
 
 		 385 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  72.97 
 
 		 548 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  70.27 
 
 		 514 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03230  transposase  65.79 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.330594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  64.86 
 
 		 522 aa  57  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>