More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4859 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



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Alignment on homolog gene

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4859  transposase IS3/IS911  100 
 
 
75 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
92 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  83.33 
 
 
92 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  81.67 
 
 
92 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  81.67 
 
 
92 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  81.67 
 
 
92 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1163  transposase IS3/IS911  88.33 
 
 
92 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966557  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  82.46 
 
 
133 aa  103  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  67.27 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  67.27 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  55.36 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  55.36 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  55.36 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  55.36 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  55.36 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  53.57 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  56.14 
 
 
88 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  60.71 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  56.14 
 
 
88 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  56.14 
 
 
88 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  59.65 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  56.36 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  58.93 
 
 
88 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  56.36 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  56.14 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0720  transposase subfamily  58.93 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.116485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  66 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  51.67 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1495  transposase IS3/IS911 family protein  45.59 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  56.14 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0036  transposase IS3/IS911 family protein  56.14 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  59.62 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  59.62 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  57.69 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  57.69 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  57.69 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  57.69 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  53.57 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  52.73 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  56.6 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1184  transposase IS3/IS911  54.9 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  56.6 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  56.6 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  56.6 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  56.6 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  52.83 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  52.46 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  52.46 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  52.46 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  52.46 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7752  putative insertion element ISR1-like protein  54.55 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619622  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  51.79 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  51.79 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  51.79 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  51.79 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  52.83 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 
92 aa  67  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  55.36 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  55.36 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  55.77 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7692  insertion element protein  53.57 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382154  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  52.73 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  52.73 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  52.73 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  52.73 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  55.36 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  55.36 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  55.36 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  55.36 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2542  transposase IS3/IS911 family protein  52.63 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  52.73 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  52.73 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  52.73 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  55.36 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  55.77 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  47.37 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  47.37 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  55.77 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  55.77 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  47.37 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  55.77 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0927  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 
75 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  55.77 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  57.69 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0857  hypothetical protein  54.55 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  42.62 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  52.63 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  57.69 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  57.69 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  57.69 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  57.69 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  52.63 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal 
 
 
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NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  52.63 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289218 
 
 
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