More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3701 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3701  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4667  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5633  alcohol dehydrogenase  98.49 
 
 
332 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.311663 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1156  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  93.05 
 
 
332 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00489379  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4057  alcohol dehydrogenase  92.75 
 
 
332 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00526605  normal  0.609446 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4513  alcohol dehydrogenase  91.54 
 
 
332 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1347  alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  51.55 
 
 
323 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  47.24 
 
 
325 aa  267  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6194  alcohol dehydrogenase  54.15 
 
 
322 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 
344 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.27 
 
 
324 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1703  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
330 aa  262  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  46.58 
 
 
324 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.08 
 
 
323 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  46.58 
 
 
324 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.99 
 
 
326 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  46.77 
 
 
323 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.99 
 
 
326 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.82 
 
 
324 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.91 
 
 
322 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 
322 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  46.53 
 
 
324 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0674  alcohol dehydrogenase  48.29 
 
 
322 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.31757 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1516  quinone oxidoreductase  47.98 
 
 
324 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000615527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  45.51 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  45.2 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.2 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  45.2 
 
 
324 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.2 
 
 
324 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  45.2 
 
 
324 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  45.2 
 
 
324 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  45.2 
 
 
324 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  45.96 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.46 
 
 
323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  46.06 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.96 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  45.96 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3912  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.67 
 
 
332 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3799  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.67 
 
 
332 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0978462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  44.18 
 
 
325 aa  252  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.98 
 
 
322 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.68 
 
 
331 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.98 
 
 
322 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0875  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.85 
 
 
324 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  44.72 
 
 
324 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.65 
 
 
323 aa  249  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  52.32 
 
 
322 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  44.89 
 
 
324 aa  248  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.65 
 
 
327 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  43.58 
 
 
331 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  43.56 
 
 
324 aa  247  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.62 
 
 
324 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.7 
 
 
323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  42.64 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.56 
 
 
325 aa  242  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.89 
 
 
331 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  44.98 
 
 
327 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.63 
 
 
324 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1614  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.3 
 
 
260 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.77 
 
 
328 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.88 
 
 
324 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 
326 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.31 
 
 
324 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.27 
 
 
325 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  41.57 
 
 
328 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 
329 aa  235  9e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.94 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  43.85 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4146  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  44.66 
 
 
315 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5962  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.57 
 
 
323 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0181365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.55 
 
 
326 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  47.19 
 
 
325 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  42.51 
 
 
325 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.32 
 
 
328 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  42.51 
 
 
325 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  42.51 
 
 
325 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.66 
 
 
326 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3432  quinone oxidoreductase  48.42 
 
 
320 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.98 
 
 
326 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  42.25 
 
 
330 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  43.25 
 
 
325 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  43.67 
 
 
324 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  42.47 
 
 
326 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
327 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  41.95 
 
 
326 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
325 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.06 
 
 
326 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0710  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  40.24 
 
 
331 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.2 
 
 
324 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
326 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 
326 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  41.27 
 
 
326 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.33 
 
 
324 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  40.98 
 
 
327 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3861  hypothetical protein  43.71 
 
 
324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
327 aa  222  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>