42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0073 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0073  hypothetical protein  100 
 
 		 773 aa  1490    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0161028  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1390  hypothetical protein  25.49 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1571  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  20.61 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0387  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  20.52 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0974  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.64 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3194  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  16.5 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  18.57 
 
 		 454 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.521272  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3194  4Fe-4S ferredoxin, RnfC  17.33 
 
 		 517 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3933  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  17.62 
 
 		 517 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00505107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0704  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  21.85 
 
 		 435 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0680  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  21.52 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1061  electron transport complex protein RnfC  22.03 
 
 		 659 aa  55.8  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0342  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  18.14 
 
 		 445 aa  54.3  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1663  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  24.79 
 
 		 436 aa  54.3  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2156  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  18.54 
 
 		 673 aa  53.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261031  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1960  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  18.79 
 
 		 398 aa  52.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.712418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02966  electron transport complex protein RnfC  22.88 
 
 		 912 aa  52  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1091  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  22.13 
 
 		 437 aa  52  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0079  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  22.59 
 
 		 443 aa  51.6  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000481582  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0988  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  21.5 
 
 		 441 aa  50.8  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1327  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  22.68 
 
 		 439 aa  49.7  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000291101  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1155  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  22.88 
 
 		 441 aa  49.7  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.47563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2197  electron transport complex protein RnfC  21.4 
 
 		 788 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2558  electron transport complex protein RnfC  24.69 
 
 		 784 aa  49.3  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0669031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1570  electron transport complex protein RnfC  16.99 
 
 		 676 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1310  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  21.85 
 
 		 441 aa  48.1  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1185  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  21.67 
 
 		 442 aa  47.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1529  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  24.88 
 
 		 441 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.427394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1818  electron transport complex protein RnfC  16.99 
 
 		 708 aa  47  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01589  hypothetical protein  16.99 
 
 		 694 aa  47.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00945839  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1885  electron transport complex protein RnfC  16.99 
 
 		 704 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002947  electron transport complex protein RnfC  26.01 
 
 		 916 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.703595  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2000  electron transport complex protein RnfC  17.12 
 
 		 740 aa  45.8  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000227688  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1705  electron transport complex protein RnfC  17.12 
 
 		 740 aa  45.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0365167  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2012  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  17.12 
 
 		 740 aa  45.8  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000275301  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01599  electron transport complex protein RnfC  17.12 
 
 		 740 aa  45.8  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105357  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1627  electron transport complex protein RnfC  17.36 
 
 		 735 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0777449  normal  0.304577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1717  electron transport complex protein RnfC  17.36 
 
 		 735 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1837  electron transport complex protein RnfC  17.12 
 
 		 740 aa  45.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0304  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  19.71 
 
 		 443 aa  45.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.980459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1555  electron transport complex protein RnfC  17.36 
 
 		 732 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.555385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1567  electron transport complex protein RnfC  17.36 
 
 		 735 aa  44.3  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0379557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>