70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4607 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2169  hypothetical protein  66.61 
 
 
638 aa  857    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5074  hypothetical protein  64.34 
 
 
644 aa  817    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3464  hypothetical protein  88.44 
 
 
640 aa  1177    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4607  hypothetical protein  100 
 
 
640 aa  1294    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0258623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5062  hypothetical protein  64.64 
 
 
644 aa  836    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.828402  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2205  hypothetical protein  73.78 
 
 
630 aa  974    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5247  hypothetical protein  84.87 
 
 
641 aa  1124    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  64.18 
 
 
644 aa  815    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0906  hypothetical protein  66.61 
 
 
638 aa  857    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0942  hypothetical protein  73.12 
 
 
638 aa  981    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1235  hypothetical protein  64.38 
 
 
641 aa  836    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4392  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  64.34 
 
 
644 aa  817    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1194  hypothetical protein  66.61 
 
 
638 aa  857    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1229  hypothetical protein  73.78 
 
 
630 aa  974    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1516  hypothetical protein  64.38 
 
 
641 aa  836    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0091  hypothetical protein  64.38 
 
 
641 aa  836    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0111  hypothetical protein  62.45 
 
 
523 aa  683    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0314  hypothetical protein  73.12 
 
 
638 aa  982    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390902  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0350  hypothetical protein  66.45 
 
 
638 aa  837    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0258  hypothetical protein  66.13 
 
 
638 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0087  hypothetical protein  64.14 
 
 
647 aa  829    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0224  hypothetical protein  73.44 
 
 
713 aa  987    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0407  hypothetical protein  82.97 
 
 
640 aa  1101    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0076  hypothetical protein  64.38 
 
 
650 aa  836    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0837767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1895  hypothetical protein  66.61 
 
 
638 aa  857    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1927  hypothetical protein  73.12 
 
 
638 aa  981    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4648  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  63.18 
 
 
643 aa  832    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.652579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4607  hypothetical protein  72.81 
 
 
638 aa  973    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6684  hypothetical protein  63.75 
 
 
660 aa  849    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182376  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1575  hypothetical protein  64.22 
 
 
650 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1677  hypothetical protein  73.28 
 
 
638 aa  981    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1708  hypothetical protein  66.13 
 
 
638 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6419  hypothetical protein  68.59 
 
 
644 aa  907    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612972  normal  0.777893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3085  hypothetical protein  63.67 
 
 
644 aa  814    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0077  hypothetical protein  65.11 
 
 
645 aa  840    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.104126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0227  hypothetical protein  72.66 
 
 
711 aa  973    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5136  hypothetical protein  98.59 
 
 
640 aa  1282    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3206  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  64.49 
 
 
644 aa  832    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5025  hypothetical protein  85.02 
 
 
641 aa  1125    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.932638  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0905  hypothetical protein  72.97 
 
 
638 aa  974    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3120  hypothetical protein  84.87 
 
 
641 aa  1124    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  29.42 
 
 
743 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3113  NHL repeat-containing protein  28.53 
 
 
708 aa  214  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4260  hypothetical protein  28.89 
 
 
729 aa  209  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770161  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  27.54 
 
 
727 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3571  hypothetical protein  26.58 
 
 
663 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68126  decreased coverage  0.00704751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1072  hypothetical protein  27.06 
 
 
761 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.437108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2230  hypothetical protein  26.75 
 
 
733 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2429  hypothetical protein  27.11 
 
 
775 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0755  hypothetical protein  27.25 
 
 
722 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.974049  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2113  hypothetical protein  25.53 
 
 
738 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1968  hypothetical protein  25.8 
 
 
733 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2290  hypothetical protein  27.25 
 
 
718 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0693  hypothetical protein  27.03 
 
 
727 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.315793  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4395  hypothetical protein  25.4 
 
 
738 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3972  hypothetical protein  25.4 
 
 
738 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3557  hypothetical protein  25.4 
 
 
738 aa  144  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.744936  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3361  hypothetical protein  25.07 
 
 
738 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3865  hypothetical protein  25.13 
 
 
730 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.647421  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2520  hypothetical protein  26.22 
 
 
808 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.432249  normal  0.0659168 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1664  hypothetical protein  26.52 
 
 
722 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1707  hypothetical protein  26.67 
 
 
669 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1872  hypothetical protein  26.67 
 
 
669 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721544  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0544  hypothetical protein  26.67 
 
 
669 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4610  hypothetical protein  25.85 
 
 
738 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0530626  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  26.08 
 
 
1259 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  28.05 
 
 
387 aa  48.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  32.26 
 
 
359 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  28.22 
 
 
1030 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  24.78 
 
 
752 aa  43.9  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>