71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0087 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1194  hypothetical protein  68.32 
 
 
638 aa  885    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2205  hypothetical protein  67.82 
 
 
630 aa  890    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4607  hypothetical protein  62.58 
 
 
640 aa  838    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0258623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5062  hypothetical protein  79.81 
 
 
644 aa  1036    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.828402  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2169  hypothetical protein  68.32 
 
 
638 aa  885    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5247  hypothetical protein  65.02 
 
 
641 aa  851    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  79.94 
 
 
644 aa  1026    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0906  hypothetical protein  68.32 
 
 
638 aa  885    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0942  hypothetical protein  67.65 
 
 
638 aa  891    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1235  hypothetical protein  99.36 
 
 
641 aa  1255    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4648  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  78.98 
 
 
643 aa  1045    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.652579 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5074  hypothetical protein  80.1 
 
 
644 aa  1028    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1229  hypothetical protein  67.82 
 
 
630 aa  890    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1516  hypothetical protein  99.36 
 
 
641 aa  1255    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0076  hypothetical protein  98.77 
 
 
650 aa  1270    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0837767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0111  hypothetical protein  99.04 
 
 
523 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0314  hypothetical protein  67.65 
 
 
638 aa  893    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390902  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0350  hypothetical protein  68.48 
 
 
638 aa  871    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0091  hypothetical protein  99.36 
 
 
641 aa  1255    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0087  hypothetical protein  100 
 
 
647 aa  1304    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0224  hypothetical protein  67.54 
 
 
713 aa  897    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0258  hypothetical protein  68.63 
 
 
638 aa  872    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4392  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  78.21 
 
 
644 aa  1031    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5136  hypothetical protein  63.35 
 
 
640 aa  844    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1895  hypothetical protein  68.32 
 
 
638 aa  885    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1927  hypothetical protein  67.65 
 
 
638 aa  891    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3206  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  79.97 
 
 
644 aa  1040    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5025  hypothetical protein  64.87 
 
 
641 aa  851    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.932638  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1575  hypothetical protein  98.77 
 
 
650 aa  1269    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1677  hypothetical protein  67.81 
 
 
638 aa  894    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1708  hypothetical protein  68.63 
 
 
638 aa  871    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0407  hypothetical protein  64.35 
 
 
640 aa  850    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3085  hypothetical protein  80.29 
 
 
644 aa  1040    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0077  hypothetical protein  87.13 
 
 
645 aa  1133    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.104126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0227  hypothetical protein  67.23 
 
 
711 aa  894    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6419  hypothetical protein  70.74 
 
 
644 aa  926    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612972  normal  0.777893 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3464  hypothetical protein  65.17 
 
 
640 aa  863    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6684  hypothetical protein  62.75 
 
 
660 aa  844    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182376  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0905  hypothetical protein  74.03 
 
 
638 aa  979    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3120  hypothetical protein  65.02 
 
 
641 aa  851    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4607  hypothetical protein  71.72 
 
 
638 aa  950    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  29.79 
 
 
743 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3113  NHL repeat-containing protein  26.82 
 
 
708 aa  191  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4260  hypothetical protein  27.18 
 
 
729 aa  174  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770161  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3571  hypothetical protein  25.98 
 
 
663 aa  164  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68126  decreased coverage  0.00704751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  25.98 
 
 
727 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1968  hypothetical protein  24.33 
 
 
733 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2230  hypothetical protein  24.6 
 
 
733 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1072  hypothetical protein  24.48 
 
 
761 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.437108 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0755  hypothetical protein  24.97 
 
 
722 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.974049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2290  hypothetical protein  24.83 
 
 
718 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2429  hypothetical protein  24.83 
 
 
775 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2113  hypothetical protein  23.48 
 
 
738 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2520  hypothetical protein  25.31 
 
 
808 aa  115  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.432249  normal  0.0659168 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3972  hypothetical protein  23.48 
 
 
738 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4395  hypothetical protein  23.48 
 
 
738 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3557  hypothetical protein  23.48 
 
 
738 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.744936  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0693  hypothetical protein  23.76 
 
 
727 aa  111  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.315793  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1872  hypothetical protein  24.31 
 
 
669 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721544  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0544  hypothetical protein  24.31 
 
 
669 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1664  hypothetical protein  24.6 
 
 
722 aa  107  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1707  hypothetical protein  24.31 
 
 
669 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365611  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3361  hypothetical protein  23.09 
 
 
738 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3865  hypothetical protein  23.28 
 
 
730 aa  105  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.647421  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4610  hypothetical protein  22.58 
 
 
738 aa  104  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0530626  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  26.63 
 
 
1026 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  26.7 
 
 
1030 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  29.37 
 
 
913 aa  45.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  27.88 
 
 
668 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  34.78 
 
 
709 aa  44.3  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  26.63 
 
 
786 aa  44.3  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>