69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4607 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1194  hypothetical protein  72.45 
 
 
638 aa  928    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4392  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  69.67 
 
 
644 aa  913    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4607  hypothetical protein  72.81 
 
 
640 aa  973    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0258623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5062  hypothetical protein  71.34 
 
 
644 aa  927    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.828402  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3464  hypothetical protein  75.78 
 
 
640 aa  1002    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5247  hypothetical protein  73.17 
 
 
641 aa  968    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  71.31 
 
 
644 aa  917    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0906  hypothetical protein  72.45 
 
 
638 aa  928    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0942  hypothetical protein  76.65 
 
 
638 aa  1028    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1235  hypothetical protein  73.11 
 
 
641 aa  939    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2205  hypothetical protein  77.19 
 
 
630 aa  1017    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5074  hypothetical protein  71.15 
 
 
644 aa  916    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1229  hypothetical protein  77.19 
 
 
630 aa  1017    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1516  hypothetical protein  73.11 
 
 
641 aa  939    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2169  hypothetical protein  72.45 
 
 
638 aa  928    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0111  hypothetical protein  71.51 
 
 
523 aa  773    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0314  hypothetical protein  76.65 
 
 
638 aa  1029    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390902  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0350  hypothetical protein  72.29 
 
 
638 aa  910    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0091  hypothetical protein  73.11 
 
 
641 aa  939    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0087  hypothetical protein  73.02 
 
 
647 aa  936    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0224  hypothetical protein  76.96 
 
 
713 aa  1033    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0258  hypothetical protein  72.29 
 
 
638 aa  909    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6684  hypothetical protein  65.67 
 
 
660 aa  882    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182376  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0076  hypothetical protein  73.11 
 
 
650 aa  940    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0837767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1895  hypothetical protein  72.45 
 
 
638 aa  928    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1927  hypothetical protein  76.65 
 
 
638 aa  1028    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4648  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  71.03 
 
 
643 aa  944    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.652579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4607  hypothetical protein  100 
 
 
638 aa  1295    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1575  hypothetical protein  73.11 
 
 
650 aa  941    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1677  hypothetical protein  76.8 
 
 
638 aa  1030    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1708  hypothetical protein  72.29 
 
 
638 aa  908    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0407  hypothetical protein  72.97 
 
 
640 aa  973    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3085  hypothetical protein  69.83 
 
 
644 aa  918    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0077  hypothetical protein  73.01 
 
 
645 aa  953    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.104126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0227  hypothetical protein  76.96 
 
 
711 aa  1029    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6419  hypothetical protein  77.07 
 
 
644 aa  1033    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612972  normal  0.777893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5136  hypothetical protein  73.12 
 
 
640 aa  975    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3206  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  71.66 
 
 
644 aa  930    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0905  hypothetical protein  93.26 
 
 
638 aa  1226    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3120  hypothetical protein  73.17 
 
 
641 aa  968    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5025  hypothetical protein  73.01 
 
 
641 aa  967    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.932638  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  29.3 
 
 
743 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3113  NHL repeat-containing protein  28.53 
 
 
708 aa  212  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  27.89 
 
 
727 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4260  hypothetical protein  27.97 
 
 
729 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770161  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3571  hypothetical protein  26.57 
 
 
663 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68126  decreased coverage  0.00704751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2230  hypothetical protein  25.73 
 
 
733 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2429  hypothetical protein  26.7 
 
 
775 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0755  hypothetical protein  26.7 
 
 
722 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.974049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2290  hypothetical protein  26.7 
 
 
718 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1968  hypothetical protein  24.8 
 
 
733 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1072  hypothetical protein  25.56 
 
 
761 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.437108 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0693  hypothetical protein  25.77 
 
 
727 aa  134  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.315793  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4395  hypothetical protein  24.17 
 
 
738 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3972  hypothetical protein  24.17 
 
 
738 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2520  hypothetical protein  25.2 
 
 
808 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.432249  normal  0.0659168 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3557  hypothetical protein  24.17 
 
 
738 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.744936  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1664  hypothetical protein  26.09 
 
 
722 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789674  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1872  hypothetical protein  26.09 
 
 
669 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721544  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0544  hypothetical protein  26.09 
 
 
669 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1707  hypothetical protein  26.09 
 
 
669 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365611  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3865  hypothetical protein  24.23 
 
 
730 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.647421  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3361  hypothetical protein  24.1 
 
 
738 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2113  hypothetical protein  24.43 
 
 
738 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4610  hypothetical protein  23.56 
 
 
738 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0530626  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  25.27 
 
 
1259 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30.71 
 
 
1026 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  24.54 
 
 
1342 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  29.23 
 
 
1314 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>