68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3206 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1194  hypothetical protein  69.07 
 
 
638 aa  876    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4392  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  88.51 
 
 
644 aa  1144    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4607  hypothetical protein  64.49 
 
 
640 aa  845    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0258623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5062  hypothetical protein  98.45 
 
 
644 aa  1273    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.828402  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3464  hypothetical protein  64.81 
 
 
640 aa  852    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5247  hypothetical protein  64.71 
 
 
641 aa  847    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  88.98 
 
 
644 aa  1145    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0906  hypothetical protein  69.07 
 
 
638 aa  876    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0942  hypothetical protein  65.16 
 
 
638 aa  868    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1235  hypothetical protein  80.13 
 
 
641 aa  1041    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2205  hypothetical protein  65.2 
 
 
630 aa  859    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5074  hypothetical protein  89.13 
 
 
644 aa  1147    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1229  hypothetical protein  65.2 
 
 
630 aa  859    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1516  hypothetical protein  80.13 
 
 
641 aa  1041    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2169  hypothetical protein  69.07 
 
 
638 aa  876    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0111  hypothetical protein  79.31 
 
 
523 aa  869    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0314  hypothetical protein  65.16 
 
 
638 aa  870    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390902  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0350  hypothetical protein  68.91 
 
 
638 aa  859    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0091  hypothetical protein  80.13 
 
 
641 aa  1041    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0087  hypothetical protein  78.98 
 
 
647 aa  1035    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0224  hypothetical protein  65.22 
 
 
713 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0258  hypothetical protein  68.59 
 
 
638 aa  853    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6684  hypothetical protein  63.68 
 
 
660 aa  827    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182376  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0076  hypothetical protein  78.77 
 
 
650 aa  1043    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0837767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1895  hypothetical protein  69.07 
 
 
638 aa  876    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1927  hypothetical protein  65.16 
 
 
638 aa  868    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4648  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  78.88 
 
 
643 aa  1038    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.652579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4607  hypothetical protein  70.81 
 
 
638 aa  946    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1575  hypothetical protein  78.92 
 
 
650 aa  1044    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1677  hypothetical protein  65.32 
 
 
638 aa  870    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1708  hypothetical protein  68.59 
 
 
638 aa  854    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0407  hypothetical protein  64.34 
 
 
640 aa  849    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3085  hypothetical protein  89.29 
 
 
644 aa  1160    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0077  hypothetical protein  80.52 
 
 
645 aa  1036    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.104126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0227  hypothetical protein  65.22 
 
 
711 aa  872    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6419  hypothetical protein  68.84 
 
 
644 aa  916    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612972  normal  0.777893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5136  hypothetical protein  64.8 
 
 
640 aa  850    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3206  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 
644 aa  1288    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0905  hypothetical protein  71.92 
 
 
638 aa  961    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3120  hypothetical protein  64.71 
 
 
641 aa  847    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5025  hypothetical protein  64.55 
 
 
641 aa  846    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.932638  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  29.29 
 
 
743 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3113  NHL repeat-containing protein  27.05 
 
 
708 aa  197  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4260  hypothetical protein  27.13 
 
 
729 aa  177  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770161  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  26.88 
 
 
727 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3571  hypothetical protein  26.49 
 
 
663 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68126  decreased coverage  0.00704751 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0755  hypothetical protein  26.64 
 
 
722 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.974049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2290  hypothetical protein  26.64 
 
 
718 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2429  hypothetical protein  26.64 
 
 
775 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2230  hypothetical protein  24.9 
 
 
733 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1968  hypothetical protein  24.23 
 
 
733 aa  142  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1072  hypothetical protein  25.85 
 
 
761 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.437108 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0693  hypothetical protein  25.73 
 
 
727 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.315793  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1664  hypothetical protein  25.67 
 
 
722 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789674  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1872  hypothetical protein  25.67 
 
 
669 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721544  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0544  hypothetical protein  25.67 
 
 
669 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1707  hypothetical protein  25.95 
 
 
669 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2520  hypothetical protein  26.02 
 
 
808 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.432249  normal  0.0659168 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4610  hypothetical protein  24.14 
 
 
738 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0530626  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4395  hypothetical protein  24.13 
 
 
738 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3972  hypothetical protein  24.13 
 
 
738 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3557  hypothetical protein  24.13 
 
 
738 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.744936  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2113  hypothetical protein  23.82 
 
 
738 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3865  hypothetical protein  23.7 
 
 
730 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.647421  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3361  hypothetical protein  23.05 
 
 
738 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  25.82 
 
 
1259 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  24.87 
 
 
522 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  26.38 
 
 
786 aa  45.8  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>